主动脉基因表达谱揭示APOA-I水平如何调节小鼠动脉粥样硬化中的炎症、溶酶体活性与鞘脂代谢

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163657

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数据说明

已知HDL颗粒具有多种抗动脉粥样硬化特性，包括清除外周组织中多余的胆固醇、维持内皮完整性、抗氧化及抗炎活性。在apoE缺陷（EKO）小鼠中过表达ApoA-I已被证明可提高HDL水平并显著减少动脉粥样硬化的发展。本研究旨在探讨EKO小鼠主动脉中与动脉粥样硬化发展相关的基因表达模式，以及血浆HDL水平在不同动脉粥样硬化发展阶段和不同饮食处理下与基因表达模式的关系。方法：将8周龄EKO小鼠、过表达人apoA-I的EKO小鼠（EKO/hA-I）以及作为对照的野生型小鼠分别喂食普通饲料或西方饮食6周或22周。评估脂蛋白间的胆固醇分布，并对主动脉粥样硬化进行定量。采用高通量测序技术分析每种实验条件下三种基因型小鼠主动脉的转录组。

结果：除了众所周知的炎症和免疫反应激活外，鞘脂代谢、吞噬体-溶酶体系统及破骨细胞分化的损伤也被发现是动脉粥样硬化发展中的重要参与者。表达高水平apoA-I的EKO小鼠主动脉中动脉粥样硬化负荷降低，同时伴随免疫系统标志物激活减少、溶酶体活性扰动减轻以及鞘脂合成途径调控改善。结论：ApoA-I通过影响除炎症和免疫反应相关通路之外的额外通路表达，调节EKO小鼠主动脉中动脉粥样硬化的发展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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