GSE151243:基于高通量RNA测序的患者样本衍生化脓性汗腺炎分子疾病特征

该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-Seq表达谱矩阵文件,针对化脓性汗腺炎患者受累与未受累皮肤样本。研究建立了基于高通量RNA测序的疾病表达特征,与既往微阵列研究高度一致,并确认了免疫应答通路、抗菌肽差异调控和补体激活等已知生物学特征,进一步刻画了皮损中补体级联的变化程度,提示宿主对细菌的

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基因组分类GPL212909606
GSE151243: A Hidradenitis Suppurativa Molecular Disease Signature Derived from Patient Samples by High-Throughput RNA Sequencing

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

GSE151243:基于高通量RNA测序的患者样本衍生化脓性汗腺炎分子疾病特征

A Hidradenitis Suppurativa Molecular Disease Signature Derived from Patient Samples by High-Throughput RNA Sequencing

该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-Seq表达谱矩阵文件,针对化脓性汗腺炎患者受累与未受累皮肤样本。研究建立了基于高通量RNA测序的疾病表达特征,与既往微阵列研究高度一致,并确认了免疫应答通路、抗菌肽差异调控和补体激活等已知生物学特征,进一步刻画了皮损中补体级联的变化程度,提示宿主对细菌的反应参与疾病发病机制。数据可用于转录组差异表达分析、疾病分子特征验证及免疫通路研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):化脓性汗腺炎是一种常见、使人衰弱的炎症性皮肤病,与免疫失调及毛囊结构和功能异常有关。很少有研究对受累和未受累皮肤的转录组谱进行表征。我们建立了基于RNA-Seq的化脓性汗腺炎表达疾病特征,并发现其与较早的基于微阵列的研究在很大程度上一致。我们确认了 underlying disease biology 的已知方面,包括已知的免疫应答通路、抗菌肽的差异调控以及补体激活。我们进一步表征了化脓性汗腺炎皮损中补体级联变化的程度,并突出一个涉及宿主对细菌反应在疾病发病机制中的特征。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21290、9606。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151243

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 02 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151243

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

化脓性汗腺炎是一种常见的、使人衰弱的炎症性皮肤病,与免疫失调及毛囊结构和功能异常相关。很少有研究对受累皮肤和未受累皮肤的转录组特征进行描述。我们建立了一个基于RNA-Seq的化脓性汗腺炎表达疾病特征谱,并发现其与早期基于微阵列的研究在很大程度上一致。我们证实了该基础疾病生物学的已知方面,包括已知的免疫应答通路、抗菌肽的差异调控以及补体激活。我们进一步描述了化脓性汗腺炎皮损中补体级联反应变化的程度,并突出显示了一个提示宿主对细菌的应答参与疾病发病机制的特征谱。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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