人巨细胞病毒诱导IL-10促进巨噬细胞内脓肿分枝杆菌增殖

该数据集来自 NCBI GEO(GSE141236),对人巨细胞病毒(HCMV)、HCMV 与脓肿分枝杆菌(M. massiliense)共感染以及脓肿分枝杆菌单独感染的巨噬细胞进行转录组测序分析

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE141236: Human Cytomegalovirus-Induced Interleukin-10 Production Promotes the Proliferation of Mycobacterium massiliense in Macrophages

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

人巨细胞病毒诱导IL-10促进巨噬细胞内脓肿分枝杆菌增殖

Human Cytomegalovirus-Induced Interleukin-10 Production Promotes the Proliferation of Mycobacterium massiliense in Macrophages

该数据集来自 NCBI GEO(GSE141236),对人巨细胞病毒(HCMV)、HCMV 与脓肿分枝杆菌(M. massiliense)共感染以及脓肿分枝杆菌单独感染的巨噬细胞进行转录组测序分析。数据包含 1 个文件,可用于比较不同感染条件下差异表达基因、层次聚类和 GO 富集通路,研究 HCMV 诱导 IL-10 产生如何影响脓肿分枝杆菌在巨噬细胞内的增殖及免疫应答(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 02 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们对 HCMV、HCMV/M. mass 和 M. mass 感染的巨噬细胞进行了转录组分析。将 HCMV 感染与对照巨噬细胞之间的 880 个差异表达基因(DEGs)进行层次聚类比较,结果显示 M. mass 共感染并未整体改变 HCMV 感染巨噬细胞的转录组。M. mass 攻击后免疫反应性低是由于 HCMV 的存在,这在基因本体(GO)分析中清晰显示。与共感染组富集的 GO 通路相比,M. mass 单独感染的巨噬细胞显示出富集的 GO 通路,包括对脂多糖(LPS)的反应以及细胞对 TNF/IL-1 的反应。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141236

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对HCMV、HCMV/马赛分枝杆菌及马赛分枝杆菌单独感染的巨噬细胞进行了转录组分析。通过层次聚类比较HCMV感染组与对照组巨噬细胞间的880个差异表达基因(DEGs),发现马赛分枝杆菌共感染并未整体改变HCMV感染巨噬细胞的转录组。基因本体(GO)分析清晰显示,马赛分枝杆菌攻击后免疫应答低下是由于HCMV的存在所致。与共感染组富集的GO通路相比,马赛分枝杆菌单独感染的巨噬细胞显示出富集的GO通路,包括对脂多糖(LPS)的应答以及细胞对TNF/IL-1的应答。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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