GSE140600：SIV感染自然宿主血液和外周淋巴结中自然杀伤细胞亚群特征

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE140600

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数据说明

本项目旨在确定自然杀伤（NK）细胞是否能够控制HIV复制并减少或消除病毒储存库，从而实现HIV治愈或功能性治愈。尽管经过三十年的研究和重大进展，HIV感染仍然是一种无法治愈的疾病。抗逆转录病毒治疗（ART）已显著降低了发病率和死亡率，但终身治疗仅具有抑制作用，并不能治愈HIV/AIDS。这是因为淋巴组织细胞中存在病毒DNA阳性（vDNA+）的储存库，其中含有完整的原病毒，被认为能够启动新一轮的HIV复制（即潜伏）。除这种可诱导的储存库外，数据还表明部分患者淋巴组织中存在持续的低水平病毒复制和病毒持续存在，这与这些组织中药物水平欠佳有关。需要能够同时解决这两个问题的策略。NK细胞是先天免疫效应细胞，通过一组激活性和抑制性受体识别病毒感染的目标，但在HIV感染者中功能失调。

值得注意的是，非洲绿猴（AGM）和白眉 mangabey 在病毒血症高峰后不久即在淋巴结滤泡内对病毒复制表现出强大的控制能力，且这种控制贯穿整个感染过程。已有若干机制被认为参与了自然宿主淋巴结中对病毒复制的强效控制，例如 NK 细胞介导的控制。事实上，我们近期已证明 NK 细胞能够以 CXCR5 依赖的方式迁移至 B 细胞滤泡中，从而参与清除病毒复制。因此，本研究的目的是在转录组水平上比较从慢性感染的 AGM 血液和外周淋巴结中分离的不同 NK 细胞亚群，以鉴定可能与有效控制 SIV 复制相关的转录组特征。这些结果随后可提供一种新方法，可用于生成

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。