apoE-/-小鼠4月龄主动脉易感与抵抗区域平滑肌细胞数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13836

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究比较了4月龄载脂蛋白E缺陷(apoE-/-)小鼠在斑块形成前易发动脉粥样硬化与抵抗动脉粥样硬化的主动脉节段中平滑肌细胞(SMCs)的基因表达。在一项平行实验中，还比较了年轻C57Bl/6小鼠的这两个区域。分离了3只雄性和3只雌性ApoE-/-小鼠的主动脉，用Triton X-100灌注以去除内皮细胞，并分为易发动脉粥样硬化区域(AA：升主动脉、主动脉弓及胸主动脉近端2 mm)和抵抗区域(TA：胸主动脉中段，即距近端2 mm以远6 mm处)。对混合总RNA进行微阵列分析(VIB-MAF)，显示244个基因存在差异表达(>2倍差异)。在AA中分别观察到186个基因上调和58个基因下调。使用实时PCR确认了6个基因的差异表达。仅在apoE-/-小鼠中显示差异表达的201个基因与动脉粥样硬化相关过程有关，如细胞黏附、增殖、分化、运动性和死亡、脂质代谢及免疫反应。

此外，AA的转录谱与更倾向于合成型的SMC表型相符。这些结果表明，在apoE-/-小鼠主动脉易发生动脉粥样硬化的部位，在实际病变形成之前，SMC的转录组已发生改变。这提示SMC除内皮细胞外，也能促进易感部位的斑块形成。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。