单胎小鼠乳腺管腔祖细胞亚群基因表达谱（基于CD24CD29CD61分选）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135636

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在野生型FVB/N小鼠中模拟了两种哺乳行为：(1) 长期哺乳后乳腺组织的正常或渐进性复旧，以及(2) 短期哺乳后的强制性或突然性复旧。为此，幼鼠在产后28至31天之间逐渐断奶（渐进性复旧），或在产后7天突然断奶（突然性复旧）。采用FACS对乳腺上皮亚群进行相对定量。基因集富集分析用于分析小鼠乳腺管腔祖细胞的基因表达数据。简言之，将乳腺单细胞悬液富集为谱系阴性（Lin−）上皮细胞，排除Lin+细胞，具体为造血细胞（生物素化CD45和TER119）、内皮细胞（生物素化CD31）和免疫细胞（生物素化BP-1）。负筛选后的细胞群体富集了管腔上皮（LE）和乳腺干细胞（MaSC）富集型/基底上皮（MaSC富集型）。对于FACS分析，Lin−群体用CD24-PE、CD29-FITC和CD61-APC标记，同时使用各自的同型对照作为阴性对照。

细胞悬液与相应抗体在冰上孵育30分钟。细胞重悬于FACS缓冲液（含1 mM EDTA、1% HI-FBS和25 mM HEPES，pH 7.0，溶于1×磷酸盐缓冲盐水）中，并在FACS BD LSR II流式细胞仪上进行分选。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。