雷公藤甲素与雷公藤内酯处理后精母细胞系GC2的lncRNA表达谱
该数据集来自NCBI GEO,包含精母细胞系GC2在暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯后的lncRNA表达谱数据,采用高通量测序进行表达谱分析

基本信息
资源简介
雷公藤甲素与雷公藤内酯处理后精母细胞系GC2的lncRNA表达谱
lncRNA expression profiles in spermatocyte cell line (GC2) after exposure to triptolide and triptonide
该数据集来自NCBI GEO,包含精母细胞系GC2在暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯后的lncRNA表达谱数据,采用高通量测序进行表达谱分析。数据覆盖1个文件,物种为小鼠(10090),平台为GPL21273。该数据可用于研究lncRNA在雷公藤甲素或雷公藤内酯诱导的生殖毒性中的作用,以及探索精子发生相关lncRNA失调与男性不育的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 01 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):雷公藤甲素或雷公藤内酯是从传统中草药雷公藤(Tripterygium wilfordii Hook f.,TWHF)中分离的主要生物活性成分,已被证明对系统性自身免疫疾病具有多种药理作用。然而,雷公藤甲素或雷公藤内酯的严重毒性,尤其是生殖毒性,阻碍了其对有生育需求人群的广泛临床应用。长链非编码(lnc)RNA对精子发生至关重要,其失调可能导致男性不育。然而,它们是否参与雷公藤甲素或雷公藤内酯诱导的生殖毒性尚不清楚。在此,我们发现将精母细胞系(GC2)暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯会导致细胞活力降低并诱导细胞凋亡和自噬。然后,使用雷公藤甲素或雷公藤内酯处理的GC2细胞的总RNA,通过链特异性(strand-sp)方法研究lncRNA表达谱。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21273、10090。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE127662
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 01 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE127662
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
雷公藤甲素或雷公藤内酯酮,作为从传统中草药雷公藤(Tripterygium wilfordii Hook f., TWHF)中分离出的主要生物活性成分,已被证明对系统性自身免疫疾病具有多种药理作用。然而,雷公藤甲素或雷公藤内酯酮的严重毒性,尤其是生殖毒性,阻碍了其在有生育需求人群中的广泛临床应用。长链非编码RNA(lncRNA)对精子发生至关重要,其失调可能导致男性不育。然而,它们是否参与雷公藤甲素或雷公藤内酯酮诱导的生殖毒性尚不清楚。本研究发现,将精母细胞系(GC2)暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯酮会导致细胞活力降低,并诱导细胞凋亡和自噬。随后,利用链特异性RNA测序技术在转录组水平上研究经雷公藤甲素或雷公藤内酯酮处理的GC2细胞总RNA的lncRNA表达谱,以帮助确定雷公藤甲素或雷公藤内酯酮诱导毒性中任何与RNA相关的机制。
基因本体论和通路分析显示,差异表达lncRNA靶标和mRNA的功能与精子发生过程中涉及的许多过程密切相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




