雷公藤甲素与雷公藤内酯处理后精母细胞系GC2的lncRNA表达谱

该数据集来自NCBI GEO,包含精母细胞系GC2在暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯后的lncRNA表达谱数据,采用高通量测序进行表达谱分析

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基因组预测GPL2127310090
GSE127662: lncRNA expression profiles in spermatocyte cell line (GC2) after exposure to triptolide and triptonide

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

雷公藤甲素与雷公藤内酯处理后精母细胞系GC2的lncRNA表达谱

lncRNA expression profiles in spermatocyte cell line (GC2) after exposure to triptolide and triptonide

该数据集来自NCBI GEO,包含精母细胞系GC2在暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯后的lncRNA表达谱数据,采用高通量测序进行表达谱分析。数据覆盖1个文件,物种为小鼠(10090),平台为GPL21273。该数据可用于研究lncRNA在雷公藤甲素或雷公藤内酯诱导的生殖毒性中的作用,以及探索精子发生相关lncRNA失调与男性不育的关联(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 01 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):雷公藤甲素或雷公藤内酯是从传统中草药雷公藤(Tripterygium wilfordii Hook f.,TWHF)中分离的主要生物活性成分,已被证明对系统性自身免疫疾病具有多种药理作用。然而,雷公藤甲素或雷公藤内酯的严重毒性,尤其是生殖毒性,阻碍了其对有生育需求人群的广泛临床应用。长链非编码(lnc)RNA对精子发生至关重要,其失调可能导致男性不育。然而,它们是否参与雷公藤甲素或雷公藤内酯诱导的生殖毒性尚不清楚。在此,我们发现将精母细胞系(GC2)暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯会导致细胞活力降低并诱导细胞凋亡和自噬。然后,使用雷公藤甲素或雷公藤内酯处理的GC2细胞的总RNA,通过链特异性(strand-sp)方法研究lncRNA表达谱。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21273、10090。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE127662

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

雷公藤甲素或雷公藤内酯酮,作为从传统中草药雷公藤(Tripterygium wilfordii Hook f., TWHF)中分离出的主要生物活性成分,已被证明对系统性自身免疫疾病具有多种药理作用。然而,雷公藤甲素或雷公藤内酯酮的严重毒性,尤其是生殖毒性,阻碍了其在有生育需求人群中的广泛临床应用。长链非编码RNA(lncRNA)对精子发生至关重要,其失调可能导致男性不育。然而,它们是否参与雷公藤甲素或雷公藤内酯酮诱导的生殖毒性尚不清楚。本研究发现,将精母细胞系(GC2)暴露于雷公藤甲素或雷公藤内酯酮会导致细胞活力降低,并诱导细胞凋亡和自噬。随后,利用链特异性RNA测序技术在转录组水平上研究经雷公藤甲素或雷公藤内酯酮处理的GC2细胞总RNA的lncRNA表达谱,以帮助确定雷公藤甲素或雷公藤内酯酮诱导毒性中任何与RNA相关的机制。

基因本体论和通路分析显示,差异表达lncRNA靶标和mRNA的功能与精子发生过程中涉及的许多过程密切相关。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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