稳态下Bcl11b缺陷调节性T细胞的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120874

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

调节性T（Treg）细胞自被发现以来，因其在自身免疫性疾病治疗中的潜在应用价值而受到深入研究。Treg细胞具有一套抑制程序，包括表面分子CD25（IL2R）、细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA4）以及糖皮质激素诱导的TNFR家族相关基因（GITR），用以限制异常和过度的炎症免疫反应。我们已经证明，Bcl11b能够结合Foxp3中的CNS2区域以及这些对Treg抑制功能至关重要的表面分子的基因位点。此外，我们还鉴定出Treg细胞中一组由Bcl11b结合直接调控的Foxp3非依赖性基因。Bcl11b还直接抑制Treg细胞中固有免疫相关分子如转录因子PU.1和ID2的表达。最后，我们还证明，去除Bcl11b会加速Treg细胞凋亡，因为与野生型Treg细胞相比，Bcl11b敲除Treg细胞中裂解的caspase 3水平显著升高。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。