p21产生生物活性分泌组使应激细胞处于免疫监视下 [dataset 1]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE117147

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数据说明

为应对各种细胞应激，周期蛋白依赖性激酶抑制剂p21会暂时中止细胞周期进程，直至应激得以解除；而对于永久受损的细胞，则会在其进入细胞衰老状态时无限期地停止细胞周期。p21通过促使Rb低磷酸化，进而抑制E2F靶基因的转录来实现这一过程。然而，p21对Rb介导的基因转录调控是否在细胞周期调控之外还控制着应激反应，目前尚不清楚。在此，我们报告，与抑制细胞生长协同作用，一个响应p21的Rb池在特定基因启动子区域与特定的Stat和Smad转录因子相互作用，从而建立一种生物活性分泌组，称为p21激活的分泌表型（PASP）。PASP包含数百种分泌因子，这些因子在短暂停滞的细胞变为衰老状态后，仍以依赖p21的方式持续表达。我们发现，PASP使处于应激状态的细胞置于免疫监视之下，这一特性在很大程度上依赖于单一因子——巨噬细胞吸引剂Cxcl14。

在小鼠中，肝细胞在p21诱导后迅速吸引巨噬细胞，并在几天后随着B细胞和T细胞的相继募集而被清除。在p21诱导后数天内恢复正常p21表达的细胞重新开始增殖，并脱离了免疫监视。总体而言，这些发现表明，应激细胞同时处于增殖停滞和免疫监视之下（以防止应激、潜在受损细胞的扩增），并且p21通过在转录水平上调控Rb来协调这些细胞自主和非自主活动。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。