转导FOXP3fl或FOXP3d2的T细胞转录组数据集
该数据集来自NCBI，包含转导FOXP3fl或FOXP3d2的T细胞转录组表达谱数据，采用高通量测序技术，涉及人类样本（9606），共1个文件
基本信息
资源简介
转导FOXP3fl或FOXP3d2的T细胞转录组数据集
GSE113010 数据集聚焦于经 FOXP3fl 或 FOXP3d2 转导的 T 细胞转录组表达谱，旨在刻画不同 FOXP3 异构体背景下 T 细胞的基因表达特征。该数据集由 NCBI 收录，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，归类于免疫系统疾病 / 其他方向，采用高通量测序进行表达谱分析，涉及人类样本（9606），平台编号为 GPL17303。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE113010_series_matrix.txt.gz，作者为 John Andersson，发布时间为 Apr 11 201。整体而言，该数据集为研究 FOXP3 异构体在 T 细胞中的转录组效应提供了可直接获取的表达谱资源。
【数据集背景】
调节性 T 细胞（Treg）能够抑制免疫反应，并已被证明可以减轻动脉粥样硬化。Treg 细胞谱系特化因子 FOXP3 对 Treg 细胞维持免疫耐受的能力至关重要。在人类中，FOXP3 存在多种不同的异构体，但它们的具体作用仍知之甚少。该数据集正是围绕这一背景，通过定义转导 FOXP3fl 或 FOXP3d2 的 T 细胞的转录组，来探索不同 FOXP3 异构体在 T 细胞中的表达特征。数据集标题为“Defining the transcriptome of T cells transduced with FOXP3fl or FOXP3d2”，英文名称为 GSE113010: Defining the transcriptome of T cells transduced with FOXP3fl or FOXP3d2。
【数据内容】
该数据集包含经 FOXP3fl 或 FOXP3d2 转导的 T 细胞的转录组表达谱数据，采用高通量测序技术获得，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL17303 和 9606。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE113010_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩包格式。数据涉及人类样本（9606），平台编号为 GPL17303。除上述信息外，源站未提供更细化的样本数量、分组结构或基因层面注释信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 John Andersson，发布时间为 Apr 11 201。数据集归类于免疫系统疾病 / 其他。源站描述说明了研究背景：Treg 细胞抑制免疫反应并减轻动脉粥样硬化，FOXP3 是 Treg 细胞谱系特化因子，对人类 Treg 细胞维持免疫耐受至关重要，而人类 FOXP3 存在多种异构体，其具体作用尚不清楚。除这些信息外，源站未提供具体的实验流程、测序平台细节或样本处理方案。
【适用场景】
该数据集适用于免疫系统疾病相关研究，尤其是围绕调节性 T 细胞、FOXP3 异构体功能以及 T 细胞转录组表达谱的分析场景。由于数据涉及经 FOXP3fl 或 FOXP3d2 转导的 T 细胞，可用于比较不同 FOXP3 异构体背景下 T 细胞的基因表达特征，也可作为高通量测序表达谱分析的教学或方法验证数据。数据集涉及人类样本（9606），适合在人类免疫学与转录组学研究中作为参考表达谱使用。具体分析目标需结合源站描述与数据内容确定，源站未提供更详细的应用说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE113010_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含 1 个文件，读取时应关注文件内的矩阵结构、样本标识与表达值编码方式。源站未提供额外的预处理步骤、标准化方法或分析流程说明，使用时应依据文件实际内容进行核对与处理。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1，样例文件为 GSE113010_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩包格式。源站未提供样本数量、重复设置、测序深度、数据质控指标或缺失值情况等质量相关信息。数据集归类于免疫系统疾病 / 其他，涉及人类样本（9606），平台编号为 GPL17303。由于源站描述主要聚焦研究背景，未提供详细的实验设计与数据处理说明，使用者在分析前应自行核对文件字段与编码，并在小样本上验证读取结果。除上述信息外，源站未提供更多质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集作者为 John Andersson，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 Apr 11 201。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款信息。使用该数据集时，应遵循来源站 NCBI 的相关规定，并依据源站提供的引用信息进行规范引用。除上述信息外，源站未提供更多引用与许可细节。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE113010
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
理由——调节性T（Treg）细胞可抑制免疫反应，并已被证明能减轻动脉粥样硬化。Treg细胞谱系特化因子FOXP3对于Treg细胞维持免疫耐受的能力至关重要。在人类中，FOXP3存在多种不同的异构体，然而，它们的具体作用尚不清楚。目的——明确两种主要FOXP3异构体FOXP3fl和FOXP3Δ2的调控与功能，并确定它们的表达是否与缺血性动脉粥样硬化性疾病相关。方法与结果——用编码不同FOXP3异构体的慢病毒转导人原代T细胞。通过流式细胞术、体外抑制实验和RNA测序分析这些细胞的表型和功能。我们还评估了激活对从健康志愿者分离的Treg细胞的影响。Treg细胞激活导致FOXP3表达增加，且主要由FOXP3Δ2组成。FOXP3Δ2诱导GARP的特异性转录，GARP通过将免疫抑制性细胞因子TGF-β锚定在活化Treg细胞的细胞膜上而发挥作用。
采用RT-PCR技术，在超过150例接受颈动脉内膜切除术的患者队列中，检测FOXP3可变剪接与动脉粥样硬化斑块稳定性之间的关系。比较无症状患者与近期（<1个月）出现血管症状（包括小卒中、短暂性脑缺血发作或一过性黑矇）患者的斑块后发现，斑块不稳定性与FOXP3Δ2转录本使用率降低相关。两组间FOXP3 mRNA总水平未见差异。结论——这些结果提示，活化的Treg细胞可抑制动脉粥样硬化病变进程，而FOXP3Δ2调控一个在人类动脉粥样硬化斑块中发挥保护作用的转录程序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
