小尺寸间充质干细胞经缺氧预处理减轻移植物抗宿主病 [转录组数据集]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE108563

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

间充质干细胞（MSCs）因其免疫抑制能力而在治疗免疫相关疾病方面备受关注。在此，我们展示了一种经缺氧和钙离子预处理的小尺寸间充质干细胞（SHC-MSCs），在治疗同种异体冲突方面展现出增强的干性和免疫调节功能。与常规培养的人脐带血间充质干细胞相比，SHC-MSCs对由MCP-1和p53/p21级联介导的传代依赖性细胞衰老具有抵抗性，并高度分泌促血管生成和免疫调节因子，从而抑制T细胞增殖。全基因组DNA甲基化组和转录组分析表明，SHC-MSCs特征性上调了免疫调节、细胞粘附和细胞周期相关基因。作为下游因子，PLK1、ZNF143、DHRS3和FOG2蛋白在SHC-MSCs的有益效应中发挥关键作用，这通过其过表达间充质干细胞中促进的自我更新、迁移、促血管生成、抗炎和T细胞抑制能力得到证实。

重要的是，给予SHC-MSCs或过表达PLK1的细胞（PLK1-MSCs）在人源化小鼠模型中显著减轻了移植物抗宿主病（GVHD）的症状，与输注初始MSCs的小鼠相比，这导致了生存率显著提高、体重减轻减少以及GVHD靶器官的组织病理学损伤减轻。总体而言，我们的研究表明，经缺氧预处理的小型MSCs可能推进针对包括GVHD在内的同种异体冲突临床治疗的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。