脐血移植后急性GVHD中PBMC亚群的基因表达谱

该数据集为GSE10572,标题为脐血移植后急性GVHD中PBMC亚群的基因表达谱,来源于NCBI。数据可用于研究脐血移植后急性GVHD中PBMC亚群的基因表达特征,支持免疫系统疾病相关的表达谱分析(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL64879606
GSE10572: Gene Expression Profiles of PBMC Subsets in Acute GVHD Following Cord Blood Transplantation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

脐血移植后急性GVHD中PBMC亚群的基因表达谱

GSE10572 是一个聚焦于脐血移植后急性移植物抗宿主病(GVHD)中外周血单个核细胞(PBMC)亚群基因表达特征的数据集,英文全称为 Gene Expression Profiles of PBMC Subsets in Acute GVHD Following Cord Blood Transplantation,来源于 NCBI。该数据集以表达谱芯片为主要技术手段,主题标签涉及 GPL6487 平台与人类(9606)样本,可用于免疫系统疾病相关研究。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE10572_series_matrix.txt.gz,由 Naoyuki Takahashi 提交,发布时间为 Feb 19 200。整体而言,它为研究脐血移植后急性 GVHD 中 PBMC 亚群的表达谱变化提供了数据基础。

【数据集背景】

该数据集关注脐血移植后急性 GVHD 这一临床问题。急性 GVHD 是异基因造血干细胞移植后的重要并发症,而脐血移植作为一种移植方式,其免疫学特征受到关注。数据集标题明确指向“脐血移植后急性 GVHD 中 PBMC 亚群的基因表达谱”,说明其设计意图在于从 PBMC 亚群层面刻画基因表达特征。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,表明其组织方式为系列集合。本站将其归类为免疫系统疾病 / 其他,与数据集主题相符。

【数据内容】

数据集英文名与源站标题一致,均为 Gene Expression Profiles of PBMC Subsets in Acute GVHD Following Cord Blood Transplantation。文件数量为 1,文件样例为 GSE10572_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6487 和 9606,分别对应表达谱芯片、芯片平台编号与人类物种。数据内容围绕 PBMC 亚群的基因表达谱展开,具体样本数量、分组信息、基因数量等细节源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Naoyuki Takahashi,发布时间为 Feb 19 200。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于样本采集方式、移植方案、GVHD 诊断标准、PBMC 亚群分选方法等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究脐血移植后急性 GVHD 中 PBMC 亚群的基因表达特征,支持免疫系统疾病相关的表达谱分析。侧写线索指出,数据可用于探索该临床情境下 PBMC 亚群的表达谱变化。由于涉及表达谱芯片数据,其典型用途包括差异表达分析、亚群间表达模式比较等,但具体分析方向需结合源站提供的样本与分组信息,源站未提供相关细节。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE10572_series_matrix.txt.gz,按文件格式读取,该文件为 GZIP 压缩包。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,读取时需注意解析矩阵中的样本信息与表达值。关于芯片平台注释、探针到基因的映射等,源站未提供进一步说明。

【质量与限制】

数据集文件数量为 1,样例为系列矩阵文件,未提供原始芯片数据或其他辅助文件。源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 的组成方式。样本量、分组、临床信息、质量控制指标等均源站未提供。因此在使用时需谨慎评估数据完整性,并参考源站获取更多元数据。发布时间为 Feb 19 200,具体年份信息不完整。

【引用与许可】

作者为 Naoyuki Takahashi,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可协议、使用限制等,源站未提供。建议使用者遵循 NCBI 及原始提交者的相关要求,具体条款源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10572

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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