人单核细胞分化中的基因表达（3D-MO）
该数据集来自 omicsdi.org，包含人单核细胞、单核细胞来源树突状细胞、单核细胞来源巨噬细胞以及经靶向 CTCF 或 RAD21 的 siRNA 处理的单核细胞来源细胞的 RNA-seq 数据，共 63 个样本
基本信息
资源简介
人单核细胞分化中的基因表达（3D-MO）
该数据集名为“Gene expression in human monocyte differentiation (3D-MO)”，来源于 omicsdi.org，属于免疫系统疾病 / 其他分类，主题标签为 Transcriptomics。其核心内容是 RNA-seq 数据，覆盖人单核细胞、单核细胞来源树突状细胞、单核细胞来源巨噬细胞，以及经靶向 CTCF 或 RAD21 的 siRNA 处理的单核细胞来源细胞。数据集共包含 63 个样本，可用于观察单核细胞向不同细胞类型分化过程中的基因表达特征，并涉及 CTCF 或 RAD21 被抑制后的转录组变化。整体而言，该数据集以转录组学手段记录了人单核细胞分化及相关处理条件下的基因表达信息，适合用于免疫细胞分化与基因调控研究。
【数据集背景】
单核细胞是免疫系统中的重要细胞类型，能够分化为树突状细胞或巨噬细胞，在免疫应答、炎症调节和疾病进程中发挥关键作用。该数据集聚焦于人单核细胞的分化过程，并进一步纳入经 siRNA 靶向 CTCF 或 RAD21 处理的单核细胞来源细胞。CTCF 和 RAD21 是已知参与染色质结构和基因调控的重要因子，因此该数据集可用于探索这些因子在单核细胞分化相关基因表达调控中的潜在作用。数据集被归类于免疫系统疾病 / 其他，表明其可能与免疫相关疾病研究存在关联，但源站未提供具体的疾病关联说明。
【数据内容】
该数据集由 RNA-seq 数据组成，样本类型包括人单核细胞、单核细胞来源树突状细胞、单核细胞来源巨噬细胞，以及经靶向 CTCF 或 RAD21 的 siRNA 处理的单核细胞来源细胞。总样本数为 63 个。主题标签为 Transcriptomics，说明数据主要反映转录组层面的基因表达信息。源站未提供具体的基因列表、表达矩阵格式、测序平台、读长、比对方法或差异表达分析结果等细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出，数据来自人单核细胞及其分化后的细胞类型，并包含 siRNA 处理条件。源站未提供样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、受试者特征、细胞培养条件、siRNA 序列或转染方法等实验细节。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关研究，尤其是人单核细胞分化、树突状细胞和巨噬细胞生成过程中的基因表达分析。由于包含靶向 CTCF 或 RAD21 的 siRNA 处理样本，也可用于研究这些因子在单核细胞来源细胞中的转录调控作用。此外，该数据集可能对免疫系统疾病相关研究具有参考价值，但源站未提供具体疾病模型或临床关联信息。适用场景包括差异表达分析、通路富集分析、转录调控网络探索等，但需结合源站未提供的实验细节进行谨慎判断。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。通常 RNA-seq 数据可用于表达定量、差异表达分析、聚类分析、通路分析等，但该数据集的具体文件格式、数据处理流程、标准化方法、参考基因组版本及分析工具均未在源站描述中说明。使用者需根据数据实际下载内容自行判断分析策略。
【质量与限制】
源站未提供质量评估信息，包括测序深度、重复性、批次效应、样本质量或数据完整性等。该数据集共 63 个样本，涵盖多种细胞类型和处理条件，但源站未说明样本分组的具体数量、生物学重复情况或统计功效。由于缺乏实验细节和分析参数，使用时应谨慎解释结果，并注意源站未提供许可信息、数据访问限制或使用条款。
【引用与许可】
源站未提供引用信息、许可协议或数据使用条款。使用者应参考 omicsdi.org 上该数据集的原始页面获取可能的引用要求或访问条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10844
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自人类单核细胞、单核细胞衍生的树突状细胞或单核细胞衍生的巨噬细胞，以及接受针对CTCF或RAD21的siRNA处理的单核细胞衍生细胞的RNA-seq数据。总共包括63个样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
