铜绿假单胞菌分泌组暴露改变烟曲霉蛋白质组与次级代谢产物

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD030171

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

囊性纤维化(CF)患者的痰液中常可培养出真菌病原体烟曲霉以及细菌铜绿假单胞菌。烟曲霉分泌多种次级代谢产物，其中胶霉毒素对宿主免疫反应具有抑制作用。本研究探讨了铜绿假单胞菌培养滤液(CuF)对真菌生长及胶霉毒素产生的影响。将烟曲霉菌丝暴露于铜绿假单胞菌菌体后，胶霉毒素产量增加而真菌生长减少。相反，将烟曲霉菌丝暴露于铜绿假单胞菌CuF后，则导致生长增加和胶霉毒素产量减少。采用定量蛋白质组学分析表征了烟曲霉暴露于铜绿假单胞菌CuF后的蛋白质组响应。观察到参与次级代谢产物生物合成(胶霉毒素、烟曲霉毒素、假曲霉毒素A)的蛋白质谱发生变化，以及参与氧化应激(如甲酸脱氢酶)和解毒(如硫氧还蛋白还原酶)的蛋白质丰度发生变化，提示细菌分泌组对真菌蛋白质组具有深远影响。

参与解毒和氧化应激的蛋白质丰度发生变化，突显了烟曲霉能够差异性地调节蛋白质合成，以应对竞争者（如铜绿假单胞菌）施加的环境压力。此类反应最终可能对宿主产生严重的不利影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。