人类小肠与乳糜泻免疫细胞单细胞转录组图谱样本

该数据集为人类小肠及乳糜泻(Celiac disease)免疫细胞的单细胞转录组图谱样本,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站归类于免疫系统疾病/其他

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基因组分类Genomics
ena-DATASET-RIMLS-08-07-2019-11:51:34:269-594 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

人类小肠与乳糜泻免疫细胞单细胞转录组图谱样本

该数据集为人类小肠及乳糜泻(Celiac disease)免疫细胞的单细胞转录组图谱样本,英文名称为 ena-DATASET-RIMLS-08-07-2019-11:51:34:269-594 - samples,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站将其归类于免疫系统疾病 / 其他。从源站描述来看,该数据集聚焦于人类小肠组织与乳糜泻状态下免疫细胞的单细胞转录组特征,旨在为相关研究提供样本层面的数据资源。整体而言,它属于免疫系统疾病领域中与小肠免疫微环境相关的组学数据集合,可用于探索乳糜泻背景下免疫细胞组成与转录状态的研究场景。

【数据集背景】

乳糜泻是一种与小肠相关的免疫系统疾病,其发生发展与肠道免疫细胞的异常活动密切相关。要理解该疾病状态下免疫细胞的变化,需要在单细胞分辨率上对肠道免疫细胞群体进行刻画。该数据集正是在这一背景下产生,源站描述明确指出其内容为人类小肠及乳糜泻中免疫细胞的单细胞转录组图谱。它同时覆盖正常小肠与乳糜泻两种状态下的免疫细胞,为比较研究提供了基础。本站将其归入免疫系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Genomics,说明其核心数据属性属于基因组学范畴,服务于免疫系统疾病相关研究。

【数据内容】

该数据集的内容为单细胞转录组图谱样本,研究对象是人类小肠以及乳糜泻状态下的免疫细胞。源站描述将其概括为“人类小肠及乳糜泻中免疫细胞的单细胞转录组图谱”。这意味着数据在单细胞层面记录了免疫细胞的转录组信息,并同时涉及小肠组织与乳糜泻这一疾病背景。数据集名称中包含“samples”字样,表明其以样本形式组织。关于具体的细胞类型清单、基因数量、细胞数量、测序深度等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,这是其来源站信息。数据集英文名称中包含 ena-DATASET 以及时间戳标识,表明其与 ENA 相关的数据集记录形式有关,但除名称本身外,源站未提供更多关于采集方式、采集地点、样本处理流程或测序平台的信息。本站分类为免疫系统疾病 / 其他,主题标签为 Genomics。整体来源信息以 omicsdi.org 及其源站描述为准,其余采集细节源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于与人类小肠免疫细胞及乳糜泻相关的单细胞转录组研究场景。例如,可用于探索乳糜泻状态下小肠免疫细胞的转录组特征,或用于正常小肠与乳糜泻样本之间的免疫细胞比较分析。由于其主题标签为 Genomics,也可作为基因组学与免疫系统疾病交叉研究的数据资源。关于具体的分析流程适配、可支持的统计方法或下游应用方向,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具或操作流程等均未在已有信息中体现。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的相应记录自行获取进一步指引。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、覆盖度、批次效应、样本量或技术限制等方面的说明。该数据集聚焦于人类小肠及乳糜泻免疫细胞的单细胞转录组图谱,但其具体质量指标与适用范围限制在已有信息中未予披露。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。使用者如需引用或使用该数据集,应参考来源站 omicsdi.org 上的相关说明。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005127

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Single cell transcriptome atlas of immune cells in human small intestine and in Celiac disease

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