CD38靶向治疗ITP随机对照试验数据集

研究基于MiBioGen和GWAS Catalog数据库的汇总GWAS数据,涵盖211个肠道微生物分类单元、1400种血浆代谢物或比值以及ITP患者队列,采用两样本孟德尔随机化方法探讨肠道微生物通过血浆代谢物影响ITP的因果通路

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2024-10-28 更新
浏览 4
其他预测primary immune thrombocytopeniaplasma metabolitesgut microbiotaMendelian randomizationmediation analyses
Dataset from the randomized controlled trial of CD38-targeted therapy in ITP

基本信息

模态
其他
大小
0.000055749 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-10-28
版本
v1

资源简介

CD38靶向治疗ITP随机对照试验数据集

Table_11_Genetically predicted plasma metabolites mediate the causal relationship between gut microbiota and primary immune thrombocytopenia (ITP).XLSX

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一个XLSX文件,标题为Table_11_Genetically predicted plasma metabolites mediate the causal relationship between gut microbiota and primary immune thrombocytopenia (ITP)。研究基于MiBioGen和GWAS Catalog数据库的汇总GWAS数据,涵盖211个肠道微生物分类单元、1400种血浆代谢物或比值以及ITP患者队列,采用两样本孟德尔随机化方法探讨肠道微生物通过血浆代谢物影响ITP的因果通路。数据可用于免疫系统疾病中肠。

【数据集背景】

配套论文《Management of Primary Immune Thrombocytopenia in Pregnancy》发表于 New England Journal of Medicine(2023),DOI:10.1056/NEJMra2214617。源站首次发布:2024-10-28。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:原发性免疫性血小板减少症(ITP)是一种免疫介导的血液系统疾病,以血小板计数减少为特征,增加出血风险。近期研究表明肠道微生物群改变与ITP发生密切相关。然而,肠道微生物群通过血浆代谢物影响ITP发生和进展的机制仍知之甚少。证据表明肠道微生物群与血浆代谢物之间存在广泛相互作用,提示肠道微生物群可能通过改变血浆代谢物影响ITP,这需要进一步研究。方法:本研究从MiBioGen和GWAS Catalog数据库获取汇总GWAS数据(包括211个肠道微生物分类单元、1400种血浆代谢物或比值以及一个ITP患者队列)。采用两样本孟德尔随机化

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 55.75 KB。数据集 DOI:10.3389/fmicb.2024.1447729.s003。

【主题与分类】

源站学科分类:Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。主题标签:primary immune thrombocytopenia、plasma metabolites、gut microbiota、Mendelian randomization、mediation analyses。本站分类:免疫系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_11_Genetically_predicted_plasma_metabolites_mediate_the_causal_relationship_between_gut_microbiota_and_primary_immune_thrombocytopenia_ITP_XLSX/27315621

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Hong, Yang; Zhang, Cuilin; Shen, Kai; Dong, Xiaoqing; Chen, Bing (2024). Table_11_Genetically predicted plasma metabolites mediate the causal relationship between gut microbiota and primary immune thrombocytopenia (ITP).XLSX. Frontiers. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_11_Genetically predicted plasma metabolites mediate the causal relationship between gut microbiota and primary immune thrombocytopenia (ITP).XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/50035698"

文件清单

  • Table_11_Genetically predicted plasma metabolites mediate the causal relationship between gut microbiota and primary immune thrombocytopenia (ITP).XLSX(55.75 KB)

文件总体积 55.75 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景原发性免疫性血小板减少症(ITP)是一种免疫介导的血液系统疾病,以血小板计数减少为特征,增加出血风险。近期研究表明,肠道菌群的改变与ITP的发生发展密切相关。然而,肠道菌群通过血浆代谢物影响ITP发生和进展的机制仍知之甚少。有证据显示,肠道菌群与血浆代谢物之间存在广泛的相互作用,提示肠道菌群可能通过改变血浆代谢物来影响ITP,这需要进一步研究。方法本研究从MiBioGen和GWAS Catalog数据库获取了汇总的GWAS数据(包括211个肠道菌群分类单元、1,400种血浆代谢物或其比值,以及一个ITP患者队列)。采用两样本孟德尔随机化(MR)方法,我们筛选了可能与ITP存在因果关系的肠道菌群和血浆代谢物。我们进一步确定了作为肠道菌群影响ITP中介的血浆代谢物,并计算了中介效应的强度。

为确保结果稳定性,我们主要采用逆方差加权(IVW)法作为主要判断指标。我们还利用MR Egger和逆方差加权法检测结果的异质性,并采用MR-Egger和MR-PRESSO方法评估是否存在多效性。结果通过两样本孟德尔随机化分析,发现8个肠道微生物类群与ITP存在因果关系。在排除6个具有多效性的血浆代谢物后,发现39个血浆代谢物与ITP存在因果关联(P 肠道微生物群可通过血浆代谢物的变化影响ITP的发生发展。鞘磷脂水平、葡萄糖与甘露糖比值以及胆红素(Z,Z)与还原尿睾酮葡萄糖醛酸苷比值是新发现的肠道微生物群影响ITP的中间介质,为临床诊断和治疗提供了潜在指标和靶点。本研究凸显了肠道微生物群与血浆代谢物在ITP背景下的复杂关系,提示了新的途

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmicb.2024.1447729.s003(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_11_Genetically_predicted_plasma_metabolites_mediate_the_causal_relationship_between_gut_microbiota_and_primary_immune_thrombocytopenia_ITP_XLSX/27315621)。

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