胎儿生长受限关键基因与通路及其与母体免疫系统失调关联的整合分析数据表1
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，为一项胎儿生长受限（FGR）整合分析研究的补充数据表，文件数量为 1
基本信息
资源简介
胎儿生长受限关键基因与通路及其与母体免疫系统失调关联的整合分析数据表1
Data_Sheet_1_Integrated Analysis of Key Genes and Pathways Involved in Fetal Growth Restriction and Their Associations With the Dysregulation of the Maternal Immune System.zip
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，为一项胎儿生长受限（FGR）整合分析研究的补充数据表，文件数量为 1。研究基于 Gene Expression Omnibus 的基因表达谱，筛选健康组与 FGR 组之间的差异表达基因，并进行功能富集与网络分析，共获得 80 个共同差异表达基因（FDR < 0.05）和 17 个显著差异表达基因（FDR < 0.005）。这些基因在胎盘免疫系统失调相关功能上富集，候选枢纽基因包括 LEP、GBP5、HLA–DQA。数据可用于 FGR 相关基因与通路及母体免疫系统失调关联的进一步研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Whole-transcriptome analysis delineates the human placenta gene network and its associations with fetal growth》发表于 BMC Genomics（2017），DOI：10.1186/s12864-017-3878-0。源站首次发布：2021-01-08。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：胎儿生长受限（FGR）是一种常见的妊娠并发症，也是婴儿死亡的风险因素。大多数 FGR 患者伴有子痫前期、妊娠期糖尿病或其他病因，使得确定 FGR 的具体分子机制变得困难。在本研究中，利用从 Gene Expression Omnibus 获得的基因表达谱进行了整合分析。筛选并评估了健康组与 FGR 组之间的差异表达基因（DEGs），并通过功能富集和网络分析进行评价。共筛选出 80 个共同 DEGs（FDR < 0.05）和 17 个显著 DEGs（FDR < 0.005）。基于 Gene Ontology 和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 通路分析，这些基因富集于胎盘免疫系统失调相关功能。在被鉴定为 FGR 和胎儿重编程候选的枢纽基因中，包括 LEP、GBP5、HLA–DQA
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 9.50 MB。数据集 DOI：10.3389/fgene.2020.581789.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Gene and Molecular Therapy、Biomarkers、Genetics、Genetically Modified Animals、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)、Epigenetics (incl. Genome Methylation and Epigenomics)。主题标签：fetal growth restriction、placenta、immune imbalance、fetal-reprogramming、integration analysis。本站分类：免疫系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Gene and Molecular Therapy、Biomarkers、Genetics、Genetically Modified Animals、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)、Epigenetics (incl. Genome Methylation and Epigenomics)。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Integrated_Analysis_of_Key_Genes_and_Pathways_Involved_in_Fetal_Growth_Restriction_and_Their_Associations_With_the_Dysregulation_of_the_Maternal_Immune_System_zip/13546358
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Wang, Xue; Zhu, Hong; Lei, Lei; Zhang, Yang; Tang, Chao; Wu, Jia-xing; et al. (2021). Data_Sheet_1_Integrated Analysis of Key Genes and Pathways Involved in Fetal Growth Restriction and Their Associations With the Dysregulation of the Maternal Immune System.zip. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-04，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Data_Sheet_1_Integrated Analysis of Key Genes and Pathways Involved in Fetal Growth Restriction and Their Associations With the Dysregulation of the Maternal Immune System.zip
- DOI：10.3389/fgene.2020.581789.s001
- 发布日期：2021-01-08
- 文件数：1 个
- 文件总体积：9.50 MB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Integrated_Analysis_of_Key_Genes_and_Pathways_Involved_in_Fetal_Growth_Restriction_and_Their_Associations_With_the_Dysregulation_of_the_Maternal_Immune_System_zip/13546358
命令行下载
curl -L -o "Data_Sheet_1_Integrated Analysis of Key Genes and Pathways Involved in Fetal Growth Restriction and Their Associations With the Dysregulation of the M.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/25995293"
文件清单
Data_Sheet_1_Integrated Analysis of Key Genes and Pathways Involved in Fetal Growth Restriction and Their Associations With the Dysregulation of the M.zip（9.50 MB）
文件总体积 9.50 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
胎儿生长受限（FGR）是一种常见的妊娠并发症，也是婴儿死亡的危险因素。大多数FGR患者伴有子痫前期、妊娠期糖尿病或其他病因，因此难以确定FGR的具体分子机制。本研究利用从Gene Expression Omnibus获得的基因表达谱进行了整合分析。筛选健康组与FGR组之间的差异表达基因（DEGs），并通过功能富集和网络分析进行评估。共筛选出80个共同DEGs（FDR < 0.05）和17个显著DEGs（FDR < 0.005）。基于Gene Ontology和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes通路分析，这些基因富集于胎盘免疫系统失调相关功能。在鉴定为FGR和胎儿重编程候选基因的核心基因中，LEP、GBP5、HLA–DQA1和CTGF通过定量聚合酶链反应、免疫组织化学和蛋白质印迹实验在胎盘组织中进行了验证。免疫失衡可能导致胎盘组织缺氧环境，从而调控胎儿重编程。
在胎盘组织和缺氧条件下的HTR8细胞中，证实了CTGF与HIF-1α水平之间存在显著关联。我们的结果表明，胎盘中的免疫失衡导致无其他并发症的FGR。我们首次提供了CTGF在FGR中作用的证据，并表明CTGF可能通过HIF-1α相关通路发挥作用。我们的发现阐明了FGR的发病机制，并提供了新的治疗靶点。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fgene.2020.581789.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Integrated_Analysis_of_Key_Genes_and_Pathways_Involved_in_Fetal_Growth_Restriction_and_Their_Associations_With_the_Dysregulation_of_the_Maternal_Immune_System_zip/13546358）。
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