饮食与细菌感染后时间对黑腹果蝇繁殖力、抗性与耐受性的影响数据

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.282f6

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数据说明

在感染面前，建立并维持有效的免疫应答可能代价高昂。感染的结果取决于宿主的两种免疫策略：抵抗与耐受。抵抗限制病原体载量，而耐受则减轻感染对适应度的影响。尽管抵抗策略已被广泛研究，耐受却较少受到关注，但如今被认为在动物宿主与病原体的相互作用中发挥着至关重要的作用。生态免疫学的一个主要挑战是理解为何有些宿主在感染时能维持其适应度，而另一些则因感染而衰竭，以及诸如饮食等外在环境因素如何影响防御。我们测试了通过限制酵母（蛋白质）造成的饮食限制是否会影响黑腹果蝇的抵抗、耐受及繁殖力。我们预测蛋白质限制会揭示感染的代价。由于传染病并非总是致命，我们使用两种低致死性细菌——大肠杆菌和乳酸乳球菌——来测试抵抗与耐受。随后，我们在感染后的两个急性期时间点，对单个果蝇的繁殖力进行了测定，并表征了细菌感染病理。

正如预期，我们的四项繁殖力指标均显示低蛋白饮食产生了负面影响，但与预测相反，饮食并未影响对两种细菌的抗性。我们发现了饮食诱导和时间依赖性的宿主对大肠杆菌耐受性变化的证据，但对乳酸乳球菌则没有。此外，这两种细菌表现出显著不同的感染特征，并在感染后至少在果蝇体内持续存在7天。我们的结果表明，尽管细菌载量很高，急性期感染并不必然导致繁殖力代价。基因型等内在变量一直是研究与宿主耐受性变异相关的主要因素，但在此我们表明，外在因素在影响

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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