自然选择与遗传漂变在MHC免疫基因变异中作用的元分析数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.g12v1

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数据集大小约 145.1 KB。

数据说明

主要组织相容性复合体（MHC）是脊椎动物免疫反应不可或缺的组成部分，并且由于强大的选择压力，它是整个基因组中多态性最高的区域之一。尽管已有超过15年的研究，但实证研究对于种群瓶颈期间作用于MHC基因的两种对立进化力量——选择和遗传漂变——的相对作用，给出了高度矛盾的阐释。在此，我们采用荟萃分析方法，对有关瓶颈对MHC多态性影响的研究结果进行量化。我们表明，在瓶颈事件之前作用于MHC位点的选择，加之瓶颈期间的漂变，其后果将导致MHC多态性的总体丧失比中性遗传多样性的丧失大约多15%。这些结果与选择应维持MHC多态性的一般预期相悖，但与近期模拟模型的结果以及至少两项实证研究的结果一致。值得注意的是，我们的结果表明，在瓶颈前的种群中，负频率依赖选择对于维持高MHC多态性可能比超显性更为重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。