两种同域啮齿动物先天免疫基因TLR2多样性与种群分化数据

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.744v6t51

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数据说明

比较免疫基因与中性标记在种群间的多样性和分化模式，有助于深入了解寄生虫介导选择的性质及其地理尺度。迄今为止，针对脊椎动物此类选择模式的研究主要集中于免疫系统的获得性分支，而寄生虫介导选择如何在脊椎动物种群内部及种群间塑造先天免疫基因，仍很大程度上未知。本文呈现了一项关于先天免疫基因Toll样受体2（TLR2）多样性和种群分化的研究，覆盖瑞典南部九个黄颈鼠（Apodemus flavicollis）和堤岸田鼠（Myodes glareolus）种群。在黄颈鼠中，TLR2多样性极低，与中性位点相比，TLR2种群分化亦很低。相反，堤岸田鼠种群内部及种群间存在多个以中等频率共现的TLR2单倍型，并观察到明显的种群间距离隔离现象。两个物种在中性位点的多样性和分化程度相似。

这些结果表明，寄生虫介导的选择对生态相似且同域分布的物种中的特定免疫基因发挥了截然不同的作用。此外，在小型地理尺度上发现堤岸田鼠TLR2种群分化的现象突出表明，脊椎动物的先天免疫防御在进化上可能比以往所认识的更具动态性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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