间日疟原虫抗原文库抗体筛查数据集：与临床保护相关的裂殖子蛋白
开发有效的疫苗将极大促进间日疟原虫疟疾的消除。全面系统地描述暴露人群中对间日疟原虫抗原的抗体，有助于指导合理的疫苗设计。在本研究中，我们调查了两个亚太地区人群中对一大文库的间日疟原虫完整胞外域裂殖子蛋白的抗体，分析了抗体水平与当前和累积疟疾暴露标志物以及社会经济和临床指标的关系
基本信息
资源简介
间日疟原虫抗原文库抗体筛查数据集：与临床保护相关的裂殖子蛋白
该数据集围绕间日疟原虫（Plasmodium vivax）抗原抗体筛查研究而建立，旨在为间日疟疾疫苗的理性设计提供免疫学依据。研究针对两个亚太地区人群，系统检测了其对一大文库的间日疟原虫完整胞外域裂殖子蛋白的抗体反应，并分析抗体水平与当前及累积疟疾暴露标志物、社会经济和临床指标之间的关系。通过这一抗体筛查，研究识别出29个自然免疫的抗原靶点，其中12个高免疫原性蛋白在所罗门群岛人群中与年龄及累积终生暴露显著相关，另有6个蛋白基于免疫原性和表达水平被进一步筛选使用。该数据集由Dryad机构发布，采用Creative Commons Zero v1.0 Universal许可，发布时间为2017年。
【数据集背景】
消除间日疟原虫疟疾需要有效的疫苗。对暴露人群中针对间日疟原虫抗原的抗体进行全面、系统的表征，有助于指导合理的疫苗设计。该数据集来源于一项抗体筛查研究，其目标是通过分析两个亚太地区人群对间日疟原虫完整胞外域裂殖子蛋白文库的抗体反应，揭示与临床保护相关的候选抗原。研究关注抗体水平与当前和累积疟疾暴露标志物、社会经济和临床指标的关系，以期发现自然免疫中的抗原靶点。
【数据内容】
数据集英文名为“Data from: An antibody screen of a Plasmodium vivax antigen library identifies novel merozoite proteins associated with clinical protection”。研究调查了一大文库的间日疟原虫完整胞外域裂殖子蛋白的抗体。通过筛查，识别出29个自然免疫的抗原靶点。其中，12个高免疫原性蛋白在所罗门群岛人群中与年龄及累积终生暴露显著相关（P<0.001-0.027）。此外，基于免疫原性和表达水平，进一步筛选出6个蛋白用于后续分析。数据集涉及两个亚太地区人群的抗体水平、当前和累积疟疾暴露标志物以及社会经济和临床指标。
【采集与来源】
该数据集来源于doi.org，由Dryad机构发布。作者包括França, Camila T.、Hostetler, Jessica B.、Sharma, Sumana、White, Michael T.、Lin, Enmoore、Kiniboro, Benson、Waltmann, Andreea、Darcy, Andrew W.、Li Wai Suen, Connie S.、Siba, Peter、King, Christopher L.、Rayner等。发布时间为2017年。研究涉及两个亚太地区人群，具体人群特征、采样地点、时间范围及样本量等详细信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于间日疟疾疫苗研发相关的免疫学分析，特别是针对裂殖子蛋白抗原的抗体反应研究。可用于探索抗体水平与疟疾暴露标志物、年龄、社会经济和临床指标之间的关系，识别自然免疫中的抗原靶点。也可用于比较不同人群中抗体反应的差异，以及筛选高免疫原性蛋白作为候选疫苗成分。此外，该数据集可能适用于疟疾流行病学、免疫学监测和疫苗设计等研究领域。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法。用户需参考原始研究或Dryad平台上的相关文档以了解数据格式、变量定义和分析流程。通常，此类数据集可能包含抗体水平测量值、暴露标志物、社会经济和临床指标等结构化数据，可通过统计软件进行分析。建议在使用前查阅原始论文以获取详细的实验设计、检测方法和数据分析策略。
【质量与限制】
该数据集基于两个亚太地区人群的抗体筛查，识别出29个抗原靶点，其中12个与年龄及累积暴露显著相关。然而，研究人群仅限于亚太地区，可能限制其结论在其他地区的普适性。此外，数据集的具体样本量、检测方法的灵敏度、抗体水平的标准化方式以及潜在混杂因素的控制等信息源站未提供。用户需注意数据可能存在的选择偏倚和未测量的变量影响。
【引用与许可】
该数据集采用Creative Commons Zero v1.0 Universal许可，允许自由使用、修改和分发，无需署名。引用时需注明数据集英文名、作者、发布机构Dryad及发布时间2017年。具体引用格式可参考Dryad平台提供的建议。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5061/dryad.pn8mn
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 171.3 KB。
数据说明
背景。开发一种有效的疫苗将极大地促进间日疟原虫疟疾的消除。对暴露人群中针对间日疟原虫抗原的抗体进行全面而系统的特征描述，有助于指导合理的疫苗设计。方法/主要发现。在本研究中，我们调查了两个亚太地区人群中针对大量间日疟原虫整个外域裂殖子蛋白库的抗体，分析了抗体水平与当前和累积疟疾暴露标志物以及社会经济和临床指标之间的关系。确定了29个自然免疫的抗原靶点。其中，12个高免疫原性蛋白与年龄显著相关，因此与所罗门群岛居民的累积终生暴露显著相关（P<0.001-0.027）。基于免疫原性和表达水平选择的6个蛋白子集，被用于检测来自巴布亚新几内亚幼儿群体血浆样本中的抗体水平，这些幼儿在暴露方面具有明确表征的个体差异。
该分析发现，临床疾病风险降低与针对P12、P41以及一个先前未被研究过的新型假设蛋白PVX_081550的抗体水平之间存在强烈关联（IRR 0.46-0.74；P<0.001-0.041）。结论/意义。这些数据强调了无偏筛选方法在识别新型疫苗候选抗原方面的优势。目前需要进行功能研究，以确定PVX_081550是自然获得性保护性免疫应答的关键组成部分、免疫状态的生物标志物，还是两者兼有。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
