CytoGate-Bench：流式与质谱细胞门控跨面板评测基准
CytoGate-Bench 是面向流式与质谱细胞术跨面板细胞群门控的评测基准，汇集 11 个队列约 835 个样本，覆盖八种标记面板，来源包括 FlowRepository、FRDR、ImmPort/ImmuneSpace 及已发表的 CyTOF 数据
基本信息
资源简介
CytoGate-Bench：流式与质谱细胞门控跨面板评测基准
CytoGate-Bench: Evaluating LLMs on Cross-Panel Cell Gating in Cytometry
CytoGate-Bench 是面向流式与质谱细胞术跨面板细胞群门控的评测基准，汇集 11 个队列约 835 个样本，覆盖八种标记面板，来源包括 FlowRepository、FRDR、ImmPort/ImmuneSpace 及已发表的 CyTOF 数据。数据统一为 Parquet 模式，提供逐事件层次化门控步骤标签，共 23,646 个专家标注实例，可用于评测大模型在跨面板细胞门控与层次分类任务上的表现，并附有逐样本基准结果（来源 DOI 解析）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：CytoGate-Bench：一个用于流式与质谱细胞术中跨面板细胞群门控的基准。打包了 11 个队列（约 835 个样本），跨越八个标记面板，来源于 FlowRepository、FRDR、ImmPort/ImmuneSpace 以及先前发表的 CyTOF 发布数据，统一为一致的 Parquet 模式，带有逐事件层次化门控步骤标签和 23,646 个专家标注的逐步骤实例。每个队列以 tar.gz 归档提供；最大的队列（Vaccine）被拆分为 2GB 分卷（按顺序拼接分卷，然后执行 'tar xzf'）。逐样本基准结果也以 benchmark.tar.gz 形式包含在内。各队列带有不同的上游许可证，因此该存档在自定义数据集条款下发布，声明每个队列的适用许可证；参见 Terms 标签页、README.md、DATA_CARD.md 和 croissant.json。
【主题与分类】
主题标签：Computer and Information Science、Medicine, Health and Life Sciences、cytometry、flow cytometry、mass cytometry、CyTOF、cell gating、hierarchical classification、panel transfer、single-cell。本站分类：免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://dataverse.harvard.edu/citation?persistentId=doi:10.7910/DVN/RDW4UL
下载信息
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源站：https://doi.org/10.7910/DVN/RDW4UL
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 11.48 GB。
数据说明
CytoGate-Bench：一个用于流式与质谱细胞术跨面板细胞群门控的基准。它汇集了11个队列（约835个样本），涵盖八个标记面板，数据来源于FlowRepository、FRDR、ImmPort/ImmuneSpace以及先前发布的CyTOF数据集，统一为一致的Parquet模式，并带有逐事件分层门控步骤标签和23,646个专家标注的逐步实例。每个队列以tar.gz归档文件形式提供；最大的队列（Vaccine）被拆分为2GB分卷（按顺序拼接分卷，然后执行“tar xzf”）。每个样本的基准测试结果也包含在benchmark.tar.gz中。各队列带有不同的上游许可证，因此该数据 deposit 在自定义数据集条款下发布，其中说明了每个队列的适用许可证；请参阅Terms选项卡、README.md、DATA_CARD.md和croissant.json。
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