Coxiella burnetii（Q热病原体）在脂肪细胞中持续存在

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-46335

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

贝纳柯克斯体是Q热的病原体，尽管存在特异性免疫反应，它仍能在人体内持续存在：然而，其储存宿主仍然未知。我们在感染后4个月，从BALB/c和C57/BL6小鼠的脂肪组织中检测到了贝纳柯克斯体，而此时在其他组织中未发现细菌。贝纳柯克斯体感染了培养的脂肪细胞，在晚期吞噬体内复制，并诱导了一种转录程序，该程序富集了与炎症反应、激素反应和细胞骨架相关的基因表达。3T3-L1（ATCC）分化脂肪细胞以每细胞50个细菌的比例，用或不用贝纳柯克斯体（NMI）刺激。每组分析了四个生物学重复。由于技术原因，一个未刺激的样本在分析中被舍弃。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。