系统免疫学方法鉴定非洲猪瘟病毒保护相关因素

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aef6ec110d5acbbecc67c6134d90e37dab29265e36d6ec807d52cf8e1a039f136

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非洲猪瘟病毒（ASFV）在家猪和野猪中引起一种致命的出血性疾病，对全球猪肉产业构成严重威胁。尽管减毒活疫苗（LAVs）前景可期，但其效力与残余毒力之间的狭窄差距带来了重大安全性挑战。本研究通过识别保护性相关的固有免疫和适应性免疫应答，填补了非洲猪瘟疫苗学中的一个关键知识空白。研究采用了一个已建立的模型，该模型包含两组基线免疫状态不同的猪（农场猪和无特定病原体[SPF]猪）。这些动物接种了一株减毒ASFV毒株，随后用一株相关的、高毒力的基因II型毒株进行攻毒。通过应用系统免疫学方法，我们将包括血清细胞因子、血液转录模块（BTMs）、T细胞应答和抗体水平在内的动力学数据与临床结局相关联，以追踪随时间推移对病毒的保护性和有害免疫应答。

Ke…，，，# 数据来源：通过系统免疫学方法识别非洲猪瘟病毒保护相关因素 数据集DOI：10.5061/dryad.cnp5hqcm5 ## 数据及文件结构描述 * Fig.1B-_clinical_scores.csv - 农场猪与SPF猪接种爱沙尼亚2014株后记录的9项参数累积临床评分，评分范围从0（正常）到3（严重异常） 变量：时间（天）、动物组别/编号、临床评分 * Fig.1B-_Temperature.csv – 农场猪与SPF猪接种爱沙尼亚2014株后的直肠温度（摄氏度） 变量：时间（天）、动物组别/编号、温度（摄氏度） * Fig.1C-Viral_loads(blood).csv – 农场猪与SPF猪接种爱沙尼亚2014株后血液样本中测得的病毒载量（gEq/mL） 变量：时间（天）、动物组别/编号、病毒载量（每毫升基因组当量）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。