细胞毒性CD8 T细胞、中性粒细胞与1型干扰素信号在HIV相关结核性脑膜炎高炎症病理中的作用

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE324044

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数据说明

免疫失调是结核性脑膜炎（TBM）致死和致残的原因之一。HIV感染者患TBM的风险最高，死亡和残疾最为严重，而抗炎治疗能改善不良结局的证据却最少。改进治疗有赖于对宿主免疫反应更精细的理解。我们利用单细胞RNA测序技术，对25例HIV相关TBM成人患者的188,983个腰椎脑脊液细胞进行了表征，并识别出与细菌载量相关的指标。患者之间的细胞组成存在异质性，但细胞因子表达较低的细胞毒性CD8 T细胞始终占主导地位，其中大量细胞表达GZMK（已知可激活补体）。在微生物学确诊的TBM中，T细胞、NK细胞和γδ细胞的细胞毒性更强，T淋巴细胞和B淋巴细胞的1型干扰素刺激更高。中性粒细胞表达的标志物提示细胞因子刺激增强、效应功能增强以及IL-8介导的外周中性粒细胞募集。在另一项纵向队列中，开始治疗后血液和脑脊液中的1型干扰素信号传导均增加。

总体而言，研究结果表明，HIV相关结核性脑膜炎患者的脑脊液中存在过度炎症性免疫反应，其特征是富含颗粒酶的细胞毒性CD8 T细胞积聚、中性粒细胞高度活化以及宿主有害的1型IFN信号传导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。