子宫内膜异位症患者与对照的Th1、Th1/17和Th17细胞亚群Bulk RNAseq

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5683/SP3/AAQUUG

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自子宫内膜异位症患者和健康对照者的循环Th1、Th1/17和Th17细胞亚群的bulk RNA测序（RNAseq）差异基因表达结果。该数据集支持提交至Queen’s University的博士论文中所呈现的分析。在存放时，由于数据与未发表的研究发现相关，因此处于禁运状态。总体而言，我们旨在全面了解子宫内膜异位症患者（n=10）与健康对照者（n=12）相比循环Th1、Th1/17和Th17细胞的转录谱。简言之，从受试者采集新鲜外周血，对外周血单个核细胞（PBMCs）进行FACS染色，并使用BD FACSAria™ III分选为存活的Th17（CD3+CD4+IFNg-IL-17+）、Th1/17（CD3+CD4+IFNg+IL-17+）和Th1（CD3+CD4+IFNg+IL-17-）细胞群体。随后从患者和对照者的Th1、Th1/17和Th17细胞群体中分离RNA。样本经质量检查后，送至McGill Genome Centre（MGC，加拿大），使用Illumina NovaSeq X Plus 10B（Illumina，美国）进行bulk RNAseq，并按照标准流程进行后续生物信息学分析。

该数据集具体展示了各比较组中差异表达基因的倍数变化值。综合来看，我们的发现揭示了子宫内膜异位症中显著的免疫重塑，并突显了一种独特的异常Th17细胞表型，促进了子宫内膜异位症的病理生理过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。