斑秃患者FOXP3+CD39+ T调节细胞缺陷及Treg TCRβ链克隆型限制研究数据集

源站描述显示研究采用流式细胞术分析 20 例活动性脱发患者与 15 名健康受试者的循环 Treg 亚群分布,并检测毛囊中 FOXP3+CD39+ Treg 细胞及 Treg 的 TCRβ 序列

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2023-06-01 更新
浏览 7
基因组分类CD 39TCR β sequencecharacterise Treg cellsFOXPPCRNext Generation Sequencing techniquesT-helper 1 cellsdisease Alopecia areatahair loss disorderTreg suppressor HLA-DRhair folliclesAlopecia areata patients show deficiency
Alopecia areata patients show deficiency of FOXP3+CD39+ T regulatory cells and clonotypic restriction of Treg TCRβ-chain, which highlights the immunopathological aspect of the disease

基本信息

模态
基因组
大小
0.001839116 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

斑秃患者FOXP3+CD39+ T调节细胞缺陷及Treg TCRβ链克隆型限制研究数据集

Alopecia areata patients show deficiency of FOXP3+CD39+ T regulatory cells and clonotypic restriction of Treg TCRβ-chain, which highlights the immunopathological aspect of the disease

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 PLOS ONE 2019 年论文,围绕斑秃(Alopecia areata)免疫病理机制,包含 15 个补充文件(docx 格式)。源站描述显示研究采用流式细胞术分析 20 例活动性脱发患者与 15 名健康受试者的循环 Treg 亚群分布,并检测毛囊中 FOXP3+CD39+ Treg 细胞及 Treg 的 TCRβ 序列。数据可用于免疫系统疾病中 Treg 亚群分析与 TCR 克隆型研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Alopecia areata patients show deficiency of FOXP3+CD39+ T regulatory cells and clonotypic restriction of Treg TCRβ-chain, which highlights the immunopathological aspect of the disease》发表于 PLOS ONE(2019),DOI:10.1371/journal.pone.0210308。源站首次发布:2019-07-05。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):斑秃(AA)是一种由针对毛囊的自身免疫反应引起的脱发疾病。T-helper 1 细胞是该疾病的主要贡献者,但关于 T 调节细胞(Tregs)在 AA 中的作用知之甚少。在此,我们通过流式细胞术分析了 20 名活动性脱发 AA 患者和 15 名健康受试者中循环 Treg 亚群的分布。Treg 抑制性 HLA-DR+ 亚群在患者中显著减少(PP = 0.001)。与对照健康皮肤相比,毛囊中的 FOXP3 CD39 Treg 细胞也减少;非病变皮肤中减少 75%,病变皮肤中减少 90%。为进一步表征 AA 中的 Treg 细胞;研究了 Tregs(CD4+CD25+FOXP3+)的 TCRβ 序列。通过 Next Generation Sequencing 技术分析 PCR 产物,显示 AA Tregs 中所有频繁的公共克隆型也存在于对照中

【数据结构与技术规格】

文件数 15 个,合计 1.84 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0210308。

【主题与分类】

源站学科分类:Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology。主题标签:CD 39、TCR β sequence、characterise Treg cells、FOXP、PCR、Next Generation Sequencing techniques、T-helper 1 cells、disease Alopecia areata、hair loss disorder、Treg suppressor HLA-DR。本站分类:免疫系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Alopecia_areata_patients_show_deficiency_of_FOXP_sub_3_sub_CD_sub_39_sub_T_regulatory_cells_and_clonotypic_restriction_of_Treg_TCR_-chain_which_highlights_the_immunopathological_aspect_of_the_disease/8795093

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Hamed, Fatma N.; Åstrand, Annika; Bertolini, Marta; Rossi, Alfredo; Maleki-Dizaji, Afsaneh; G. Messenger, Andrew; et al. (2019). Alopecia areata patients show deficiency of FOXP3+CD39+ T regulatory cells and clonotypic restriction of Treg TCRβ-chain, which highlights the immunopathological aspect of…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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命令行下载

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文件清单

  • pone.0210308.s001.docx(28.44 KB)
  • pone.0210308.s002.docx(12.55 KB)
  • pone.0210308.s003.docx(12.43 KB)
  • pone.0210308.s004.docx(12.48 KB)
  • pone.0210308.s005.docx(13.32 KB)
  • pone.0210308.s006.docx(12.88 KB)
  • pone.0210308.s007.docx(13.30 KB)
  • pone.0210308.s008.docx(13.33 KB)
  • pone.0210308.s009.tif(295.33 KB)
  • pone.0210308.s010.tif(117.26 KB)
  • pone.0210308.s011.tif(679.77 KB)
  • pone.0210308.s012.tif(212.87 KB)
  • pone.0210308.s013.tif(219.85 KB)
  • pone.0210308.s014.png(97.82 KB)
  • pone.0210308.s015.tif(97.47 KB)

文件总体积 1.84 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

斑秃(AA)是一种由针对毛囊的自身免疫反应所致的脱发疾病。T辅助1细胞是该病的主要致病因素,但关于调节性T细胞(Tregs)在斑秃中的作用所知甚少。本研究采用流式细胞术分析了20例活动性脱发斑秃患者和15名健康受试者外周血Treg亚群的分布。患者的Treg抑制性HLA-DR+亚群显著减少(PP = 0.001)。与对照健康皮肤相比,毛囊中FOXP3 CD39 Treg细胞亦减少,非皮损皮肤减少75%,皮损皮肤减少90%。为进一步表征斑秃中的Treg细胞,对Tregs(CD4+CD25+FOXP3+)的TCRβ序列进行了研究。经下一代测序技术分析PCR产物显示,斑秃Tregs中所有常见的公共克隆型在对照中也以相对相似的频率存在,但有两个公共克隆型例外:CATSRDEGGLDEKLFF(V15 D1 J1-4)和CASRDGTGPSNYGYTF(V2 D1 J1-2),这两个克隆型仅存在于对照中。

这表明这些Treg克隆型可能具有保护作用,并且它们可能是未来治疗应用中一个令人兴奋的研究对象。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0210308(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Alopecia_areata_patients_show_deficiency_of_FOXP_sub_3_sub_CD_sub_39_sub_T_regulatory_cells_and_clonotypic_restriction_of_Treg_TCR_-chain_which_highlights_the_immunopathological_aspect_of_the_disease/8795093)。

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