微环境细胞因子诱导衰老分化细胞逆转为类天然干细胞状态以维持终身稳态与组织修复

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE303805

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究组织再生过程中驱动去分化和干细胞可塑性的分子机制，我们在完全消融角膜缘干细胞（LSC）群体后的多个时间点——第2天、第5天、第10天和第40天——进行了单细胞RNA测序。主要目标是表征使分化上皮细胞重新获得干细胞样特性并恢复LSC池的转录重编程过程。具体而言，我们旨在确定：（1）去分化细胞在多大程度上重新获得天然干细胞表型；（2）这种可塑性是否在晚期分化和衰老细胞中得以维持；（3）调控这一过程的微环境信号。我们的数据揭示，分化细胞经历广泛的转录重塑，变得几乎与天然LSC无法区分，并在反复损伤后功能性地维持长期组织稳态和修复。值得注意的是，这种可塑性即使在晚期分化和衰老细胞中也能保留。在机制上，我们鉴定出巨噬细胞来源的细胞因子是促进去分化和干性重新获得的关键微环境因子。

该数据集提供了角膜再生的全面转录资源，为了解干细胞可塑性和免疫微环境相互作用提供了见解，对再生医学和角膜缘干细胞缺乏症治疗具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。