乳糜泻患者IgA浆细胞配对免疫球蛋白重轻链序列
该数据集包含从五名乳糜泻患者十二指肠活检组织中分离的803个单IgA浆细胞所获得的配对免疫球蛋白重链和轻链序列。这些细胞特异性针对酶TG2的离散抗原区域,而TG2是乳糜泻的主要自身抗原

基本信息
资源简介
乳糜泻患者IgA浆细胞配对免疫球蛋白重轻链序列
该数据集收录了与乳糜泻相关的免疫球蛋白序列信息,来源于对特定自身抗原反应性浆细胞的单细胞研究。乳糜泻是一种由免疫系统介导的疾病,其主要自身抗原为转谷氨酰胺酶2(TG2)。本数据集聚焦于从患者十二指肠活检组织中分离出的单IgA浆细胞,获取其配对的免疫球蛋白重链和轻链序列。这些细胞表现出对TG2酶离散抗原区域的特异性识别,为研究乳糜泻中自身反应性B细胞/浆细胞的免疫球蛋白基因特征提供了序列层面的基础资料。数据集以英文名称“175955d8-c53f-4e4c-afa3-ba58db272b6a - samples”标识,在分类上归属于免疫系统疾病/其他,主题标签为基因组学,来源站为omicsdi.org。
【数据集背景】
乳糜泻是一种自身免疫性疾病,其主要自身抗原是酶TG2(转谷氨酰胺酶2)。在乳糜泻的免疫病理过程中,针对TG2的自身抗体反应是重要特征之一。产生这些自身抗体的细胞主要为IgA型浆细胞。理解这些浆细胞所表达的免疫球蛋白重链和轻链序列,有助于深入认识自身反应性免疫球蛋白的配对特征和抗原特异性。本数据集正是在这一背景下,从乳糜泻患者的十二指肠活检组织中分离单IgA浆细胞,并获取其配对的免疫球蛋白重链和轻链序列,所针对的抗原是TG2的离散抗原区域。
【数据内容】
数据集包含从五名乳糜泻患者十二指肠活检组织中分离的803个单IgA浆细胞所获得的配对免疫球蛋白重链和轻链序列。这些细胞特异性针对酶TG2的离散抗原区域。数据以样本形式组织,英文名称标识为“175955d8-c53f-4e4c-afa3-ba58db272b6a - samples”。主题标签为基因组学。除上述信息外,源站未提供关于序列具体格式、文件类型、序列长度分布、克隆型分析或体细胞突变负荷等更详细的数据内容描述。
【采集与来源】
数据来源于五名乳糜泻患者的十二指肠活检组织。研究人员从这些活检组织中分离出单IgA浆细胞,共803个。这些细胞被确认特异性针对TG2的离散抗原区域。配对免疫球蛋白重链和轻链序列即从这些单细胞中获得。来源站为omicsdi.org。除上述采集组织类型、细胞类型、细胞数量、患者数量及抗原特异性信息外,源站未提供关于具体采样时间、地点、患者临床特征、伦理审批信息或测序平台等更多采集细节。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集可用于涉及乳糜泻自身免疫反应的研究场景,特别是针对TG2特异性IgA浆细胞的免疫球蛋白重链和轻链配对序列分析。潜在应用包括研究自身反应性免疫球蛋白的序列特征、重链与轻链的配对偏好,以及比较不同患者来源的TG2特异性浆细胞序列。由于主题标签为基因组学,该数据集也可作为基因组学相关分析中关于免疫受体序列的参考数据。但需注意,源站未提供关于该数据集在其他具体研究场景中已验证用途的信息。
【使用方法】
源站未提供关于数据下载方式、文件格式、数据处理流程、分析工具或代码的具体说明。因此,无法依据现有信息给出具体的使用方法指导。使用者可能需要参考来源站omicsdi.org上该数据集的原始页面以获取进一步的使用说明。
【质量与限制】
该数据集基于五名乳糜泻患者的803个单IgA浆细胞,样本量和患者数量有限。所有细胞均特异性针对TG2的离散抗原区域,因此数据仅反映这一特定抗原特异性下的免疫球蛋白序列特征,不能直接推广到其他抗原特异性或非乳糜泻人群。源站未提供关于测序深度、序列准确性、污染控制、批次效应或数据完整性等质量评估信息。此外,源站未提供关于患者临床异质性、疾病活动度或治疗状态等可能影响数据解释的背景信息。因此,在使用该数据集时,应充分考虑其样本来源的局限性和缺乏详细质量元数据的情况。
【引用与许可】
源站未提供关于该数据集的引用格式、许可协议或使用限制的信息。使用者应直接访问来源站omicsdi.org查询相关引用与许可要求。
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005029
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从五名乳糜泻患者的十二指肠活检样本中分离出803个单一IgA浆细胞,并获得了配对的免疫球蛋白重链和轻链序列。这些细胞对酶TG2的特定抗原区域具有特异性,TG2是乳糜泻的主要自身抗原。
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