健康人与慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞经肽聚糖和脂多糖刺激后的转录谱分析

健康人与慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞经肽聚糖和脂多糖刺激后的转录谱分析 [数据集]。主题标签:免疫系统疾病、慢性肉芽肿病、外周血单核细胞、转录谱分析、肽聚糖、脂多糖

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基因组分类免疫系统疾病慢性肉芽肿病外周血单核细胞转录谱分析肽聚糖脂多糖
Transcription profiling of peripheral blood monocytes from healthy humans and from those with Chronic Granulamatous Disease in response to stimulation with peptidoglycan and lipopolysaccharide

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

健康人与慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞经肽聚糖和脂多糖刺激后的转录谱分析

本数据集为一项转录谱分析研究的数据集,英文名称为“Transcription profiling of peripheral blood monocytes from healthy humans and from those with Chronic Granulamatous Disease in response to stimulation with peptidoglycan and lipopolysaccharide”。该数据集聚焦免疫系统疾病领域中的慢性肉芽肿病,研究对象为健康人与慢性肉芽肿病患者的外周血单核细胞,并对其进行肽聚糖和脂多糖刺激,进而获取转录谱分析结果。数据集来源于 ebi.ac.uk,属于 ArrayExpress 实验数据,实验编号为 E-FPMI-9。该数据集可用于观察不同来源单核细胞在特定刺激条件下转录层面的反应差异,主题标签涵盖免疫系统疾病、慢性肉芽肿病、外周血单核细胞、转录谱分析、肽聚糖和脂多糖。

【数据集背景】

慢性肉芽肿病是一种免疫系统疾病,本数据集围绕该疾病展开研究。研究关注健康人与慢性肉芽肿病患者的外周血单核细胞,在肽聚糖和脂多糖刺激条件下进行转录谱分析。该数据集的源站描述中记录作者为 Karsten Hokamp 和 Kelly Brown,年份为 2008 年,数据集标题明确指向健康人与慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞在肽聚糖和脂多糖刺激后的转录谱分析。数据集所属分类为免疫系统疾病 / 慢性肉芽肿病,来源站为 ebi.ac.uk。

【数据内容】

该数据集的内容为转录谱分析数据,研究对象是外周血单核细胞,样本来源包括健康人和慢性肉芽肿病患者。实验处理包括使用肽聚糖和脂多糖进行刺激。数据集的主题标签包括免疫系统疾病、慢性肉芽肿病、外周血单核细胞、转录谱分析、肽聚糖、脂多糖。关于样本数量、转录本数量、具体基因列表、表达值矩阵、统计检验结果等更细粒度的数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为:Karsten Hokamp; Kelly Brown (2008). Transcription profiling of peripheral blood monocytes from healthy humans and from those with Chronic Granulamatous Disease in response to stimulation with peptidoglycan and lipopolysaccharide [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-FPMI-9/。该数据集属于 ArrayExpress 实验,实验编号为 E-FPMI-9。关于具体的采集时间、采集地点、样本处理流程、测序或芯片平台、试剂批次等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病特别是慢性肉芽肿病相关的研究场景,可用于分析健康人与慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞在肽聚糖和脂多糖刺激下的转录谱差异。其主题标签涵盖免疫系统疾病、慢性肉芽肿病、外周血单核细胞、转录谱分析、肽聚糖和脂多糖,因此可用于与这些主题相关的数据探索、方法比较或二次分析。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、生物标志物筛选等具体应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,实验编号为 E-FPMI-9,可通过源站描述中给出的链接 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-FPMI-9/ 访问。关于数据下载格式、预处理步骤、归一化方法、分析工具、代码示例等使用方法细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 2008 年发布的转录谱分析数据集,来源站为 ebi.ac.uk,实验编号为 E-FPMI-9。关于数据质量评估、批次效应、样本量、重复数、缺失值、技术偏差、验证实验等质量与限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Karsten Hokamp; Kelly Brown (2008). Transcription profiling of peripheral blood monocytes from healthy humans and from those with Chronic Granulamatous Disease in response to stimulation with peptidoglycan and lipopolysaccharide [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-FPMI-9/。关于该数据集的许可条款、使用限制、再分发条件等许可信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-FPMI-9

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Karsten Hokamp; Kelly Brown (2008). 健康人和慢性肉芽肿病患者外周血单核细胞对肽聚糖和脂多糖刺激反应的转录谱分析 [数据集]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-FPMI-9/

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