p67phox 活性 N 端区域:1.8 埃分辨率结构及与慢性肉芽肿病相关的 A128V 突变体生化表征
p67phox 的活性 N 端区域:1.8 埃分辨率结构及与慢性肉芽肿病相关的 A128V 突变体的生化表征 [数据集]

基本信息
资源简介
p67phox 活性 N 端区域:1.8 埃分辨率结构及与慢性肉芽肿病相关的 A128V 突变体生化表征
该数据集为一项结构生物学与免疫系统疾病交叉领域的研究数据,英文名称为“The active N-terminal region of p67phox: Structure at 1.8 Angstrom resolution and biochemical characterizations of the A128V mutant implicated in chronic granulomatous disease”,中文可译为“p67phox 的活性 N 端区域:1.8 埃分辨率结构及与慢性肉芽肿病相关的 A128V 突变体的生化表征”。该数据集收录于本站免疫系统疾病 / 慢性肉芽肿病分类之下,来源站为 ebi.ac.uk,属于欧洲蛋白质数据库(Protein Data Bank in Europe,PDBe)发布的数据资源。其内容围绕 p67phox 蛋白活性 N 端区域的高分辨率结构信息,以及 A128V 突变体的生化表征展开,该突变体与慢性肉芽肿病相关。整体而言,该数据集面向对慢性肉芽肿病分子机制、p67phox 蛋白结构与功能关系以及相关突变体生化特性感兴趣的研究人员,提供结构解析与生化表征层面的数据支撑。
【数据集背景】
慢性肉芽肿病是一种与免疫系统相关的疾病,其分子基础常涉及吞噬细胞相关蛋白的功能异常。p67phox 是相关蛋白体系中的重要组成部分,其活性 N 端区域在功能发挥中具有关键作用。该数据集聚焦于 p67phox 的活性 N 端区域,并特别关注 A128V 突变体,该突变体被认为与慢性肉芽肿病相关。通过结构解析与生化表征相结合的方式,该数据集旨在为理解该突变如何影响蛋白结构与功能提供数据基础。本站将其归类于免疫系统疾病 / 慢性肉芽肿病,说明其应用背景与免疫系统疾病研究密切相关。
【数据内容】
该数据集的核心内容包括两部分:其一为 p67phox 活性 N 端区域在 1.8 埃分辨率下的结构信息;其二为 A128V 突变体的生化表征数据。1.8 埃分辨率属于较高分辨率水平,通常能够为原子级别的结构分析提供支持。A128V 突变体则与慢性肉芽肿病相关联,因此其生化表征有助于揭示该突变对蛋白行为的影响。数据集名称中同时包含结构解析与生化表征,表明其内容不仅限于三维结构坐标,还可能涉及突变体在生化层面的表现。除上述信息外,源站未提供更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,具体由欧洲蛋白质数据库(Protein Data Bank in Europe,PDBe)发布。源站描述显示,该数据集于 2001 年发布,并通过 DOI 链接 http://doi.org/10.2210/pdb/1hh8/pdb 进行标识。该 DOI 指向蛋白质数据库中的条目 1hh8,表明该数据集与 PDB 条目直接关联。数据集的英文名称、分类信息及来源描述均来自该来源站。除上述来源信息外,源站未提供关于实验方法、样本来源、采集设备或具体采集流程的进一步说明。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性肉芽肿病相关的分子机制研究,尤其是涉及 p67phox 蛋白活性 N 端区域的结构与功能分析。研究人员可利用该数据集探讨 A128V 突变对蛋白结构的影响,或将其作为突变体生化表征的参考。此外,该数据集也可用于免疫系统疾病分类下的结构生物学研究,帮助理解蛋白质结构异常与疾病表型之间的潜在联系。对于从事蛋白质结构解析、突变体分析或慢性肉芽肿病相关基础研究的人员,该数据集可提供结构层面的数据支持。除上述场景外,源站未提供其他具体适用场景说明。
【使用方法】
该数据集可通过源站提供的 DOI 链接进行访问,即 http://doi.org/10.2210/pdb/1hh8/pdb。用户可依据该链接获取欧洲蛋白质数据库(PDBe)中对应的数据条目。由于数据集与 PDB 条目 1hh8 相关联,使用者可按照 PDBe 或 PDB 的常规数据检索与下载流程获取结构数据。对于 A128V 突变体的生化表征部分,用户可结合数据集名称所指示的内容进行查阅。除上述访问方式外,源站未提供关于数据格式、文件组成、解析工具或具体使用步骤的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集的结构信息分辨率为 1.8 埃,这一分辨率通常能够支持较精细的结构分析。数据集由欧洲蛋白质数据库(PDBe)发布,来源站为 ebi.ac.uk,并具有明确的 DOI 标识,表明其具备可引用性与可追溯性。然而,源站未提供关于数据完整性、验证方法、误差范围或重复性检验的具体信息。此外,关于 A128V 突变体生化表征的具体指标、实验条件及结果范围,源站亦未提供详细说明。因此,在使用该数据集时,用户需结合源站条目中的原始记录进行判断。除上述内容外,源站未提供其他质量与限制方面的说明。
【引用与许可】
该数据集的引用信息为:Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2001). The active N-terminal region of p67phox: Structure at 1.8 Angstrom resolution and biochemical characterizations of the A128V mutant implicated in chronic granulomatous disease [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/1hh8/pdb。该引用格式包含发布机构、发布年份、数据集名称及 DOI 链接。关于该数据集的许可条款、使用限制或再分发条件,源站未提供具体说明。用户在使用或引用该数据集时,应参照源站条目中的许可与使用政策。除上述引用信息外,源站未提供其他许可相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/1hh8
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
欧洲蛋白质数据库(PDBe)(2001)。p67phox活性N端区域:1.8埃分辨率结构及与慢性肉芽肿病相关的A128V突变体的生化特性[数据集]。http://doi.org/10.2210/pdb/1hh8/pdb
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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