侵袭性曲霉病人类表达谱
GSE78000 是侵袭性曲霉病相关 GEO 数据集，聚焦免疫受损患者宿主表达变化，可用于曲霉病分类、差异基因、miRNA/mRNA网络和诊断标志物筛选。
基本信息
资源简介
侵袭性曲霉病人类表达谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-Wide Expression Profiling Reveals S100B as Biomarker for Invasive Aspergillosis》。源站首次发布：Feb 17 201。
【数据内容】
源站原始描述：Invasive aspergillosis (IA) is a devastating opportunistic infection and its treatment constitutes a considerable burden for the health care system. Immunocompromised patients are at an increased risk for IA, which is mainly caused by the species Aspergillus fumigatus. An early and reliable diagnosis is required to initiate the appropriate antifungal therapy. However, diagnostic sensitivity and accuracy still needs to be improved, which can be achieved at least partly by the definition of new bi…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL21464、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE78000
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 04 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE78000
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE78000 包含侵袭性曲霉病相关人类表达谱，用于宿主反应和诊断标志物分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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