人单核细胞对烟曲霉刺激表达数据

GSE65088 是宿主免疫细胞对烟曲霉刺激反应的公开表达数据,可用于曲霉病相关宿主免疫特征、真菌感染分类和炎症通路分析。

NCBI Gene Expression OmnibusNCBI Gene Expression Omnibus
GEO
2017-01-01 更新
浏览 32
表格分类Expression profiling by arrayGPL105589606
GSE65088 Aspergillus-stimulated Monocytes

基本信息

模态
表格
大小
0.037748996 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2017-01-01

资源简介

人单核细胞对烟曲霉刺激表达数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Biomarker-based classification of bacterial and fungal whole-blood infections in a genome-wide expression study》。源站首次发布:Jan 19 201。

【数据内容】

源站原始描述:Sepsis is a clinical syndrome that can be caused by bacteria or fungi. Early knowledge on the nature of the causative agent is a prerequisite for targeted anti-microbial therapy. Besides currently used detection methods like blood culture and PCR-based assays, the analysis of the transcriptional response of the host to infecting organisms holds great promise. In this study, we aim to examine the transcriptional footprint of infections caused by the bacterial pathogens Staphylococcus aureus and E…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65088

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65088

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GSE65088 包含人源免疫细胞受烟曲霉刺激后的表达数据,可用于区分真菌和细菌感染反应。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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