T辅助细胞谱系特化全局调控因子鉴定（RNA-Seq）
该数据集来自 omicsdi.org，属于免疫系统疾病与过敏领域，采用 RNA-Seq 技术。研究目的是在全基因组范围鉴定人脐血来源 CD4+ T 细胞早期分化过程中基因表达的调控因子，细胞分别在 Th1（Act+IL12）和 Th2（Act+IL4）极化条件下培养
基本信息
资源简介
T辅助细胞谱系特化全局调控因子鉴定（RNA-Seq）
该数据集来自 omicsdi.org，属于免疫系统疾病与过敏领域，采用 RNA-Seq 技术。研究目的是在全基因组范围鉴定人脐血来源 CD4+ T 细胞早期分化过程中基因表达的调控因子，细胞分别在 Th1（Act+IL12）和 Th2（Act+IL4）极化条件下培养。数据将初始 CD4+ T 细胞的总 RNA 与三种培养条件（活化+antiIL4+antiIFNG、活化+IL12+antiIL4、活化+IL4+antiIFNG）下的总 RNA 进行比较，包含 3 个生物学重复。可用于分析 T 辅助细胞谱系特化的转录调控机制（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集的目的是在全基因组范围内鉴定人脐血来源 CD4+ T 细胞早期分化过程中基因表达的调控因子，这些细胞在 Th1（Act+IL12）和 Th2（Act+IL4）极化条件下培养。将初始 CD4+ T 细胞的总 RNA 与在以下三种条件下培养的细胞的总 RNA 进行比较：活化（antiCD3+antiCD28）+antiIL4+antiIFNG；活化（antiCD3+antiCD28）+IL12+antiIL4；活化（antiCD3+antiCD28）+IL4+antiIFNG。分析了来自 3 个生物学重复的样本。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：免疫系统疾病/过敏。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71645
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71645
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集旨在鉴定在人脐带血来源的CD4+ T细胞早期分化过程中，在Th1（Act+IL12）和Th2（Act+IL4）极化条件下培养时基因表达的全基因组调控因子。将初始CD4+ T细胞的总RNA与在以下三种条件下培养的细胞的总RNA进行比较：活化（antiCD3+antiCD28）+antiIL4+antiIFNG；活化（antiCD3+antiCD28）+IL12+antiIL4；活化（antiCD3+antiCD28）+IL4+antiIFNG。分析了3个生物学重复的样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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