T辅助细胞谱系特化全局调控因子鉴定 (BeadChip)
该数据集来自 omicsdi.org,属于免疫系统疾病与过敏分类,主题为转录组学。数据针对人脐血来源 CD4+ T 细胞早期分化过程,在 Th1(Act+IL12)和 Th2(Act+IL4)极化条件下培养,比较 naive CD4+ T 细胞与三种培养条件细胞的总 RNA,包含 3 个生物学重复

基本信息
资源简介
T辅助细胞谱系特化全局调控因子鉴定 (BeadChip)
该数据集来自 omicsdi.org,属于免疫系统疾病与过敏分类,主题为转录组学。数据针对人脐血来源 CD4+ T 细胞早期分化过程,在 Th1(Act+IL12)和 Th2(Act+IL4)极化条件下培养,比较 naive CD4+ T 细胞与三种培养条件细胞的总 RNA,包含 3 个生物学重复。可用于识别 T 辅助细胞谱系特化相关的全基因组基因表达调控因子,支持免疫分化机制与过敏相关研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集的目的是鉴定人脐血来源 CD4+ T 细胞在 Th1(Act+IL12)和 Th2(Act+IL4)极化条件下早期分化过程中基因表达的全基因组调控因子。将 naive CD4+ T 细胞的总 RNA 与在以下三种条件下培养的细胞的总 RNA 进行比较:激活(antiCD3+antiCD28)+antiIL4+antiIFNG;激活(antiCD3+antiCD28)+IL12+antiIL4;激活(antiCD3+antiCD28)+IL4+antiIFNG。分析了来自 3 个生物学重复的样本。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:免疫系统疾病/过敏。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71575
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71575
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集旨在鉴定人脐血来源CD4+ T细胞在Th1(Act+IL12)和Th2(Act+IL4)极化条件下培养的早期分化过程中基因表达的全基因组调控因子。将初始CD4+ T细胞的总RNA与在以下三种条件下培养的细胞的总RNA进行比较:活化(抗CD3+抗CD28)+抗IL4+抗IFNG;活化(抗CD3+抗CD28)+IL12+抗IL4;活化(抗CD3+抗CD28)+IL4+抗IFNG。分析了3个生物学重复的样本。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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