扁桃体表达数量性状位点验证并扩展儿童特应性疾病遗传因素

该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,标题为扁桃体表达数量性状位点验证并扩展儿童特应性疾病遗传因素,分类属免疫系统疾病与过敏

geo
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基因组分类SNP genotyping by SNP arrayGPL233919606
GSE336131: Tonsillar expression quantitative trait loci verify and expand genetic contributors to childhood atopic diseases

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

扁桃体表达数量性状位点验证并扩展儿童特应性疾病遗传因素

GSE336131 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,标题为“Tonsillar expression quantitative trait loci verify and expand genetic contributors to childhood atopic diseases”,即通过扁桃体表达数量性状位点验证并扩展儿童特应性疾病的遗传因素。该数据集归入免疫系统疾病与过敏分类,由 Benjamin F. Voight 提交,发布时间为 Jun 22 202。源站说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,数据集仅包含 1 个文件,样例文件为 GSE336131_series_matrix.txt.gz。主题标签涉及 SNP array 的 SNP 分型、平台 GPL23391 以及物种编号 9606。整体而言,该数据集面向儿童特应性疾病的遗传学与表达调控研究,提供可用于核对和接入的表达数量性状位点相关数据。

【数据集背景】

该数据集聚焦儿童特应性疾病(childhood atopic diseases)的遗传因素。标题中的“扁桃体表达数量性状位点”(Tonsillar expression quantitative trait loci)表明研究关注扁桃体组织中的表达数量性状位点,并以此验证和扩展与儿童特应性疾病相关的遗传贡献。数据集在 NCBI GEO 上以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,说明其结构上是对相关子系列的综合汇总。本站将其归类为免疫系统疾病 / 过敏,与特应性疾病这一过敏相关主题相符。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE336131_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩的系列矩阵文本文件。主题标签包括“SNP genotyping by SNP array”、平台编号 GPL23391 和物种编号 9606。源站未提供矩阵文件的具体字段、样本数量、探针或 SNP 数量等细节。由于该数据集为 SuperSeries,其实际数据内容可能分布在所列的 SubSeries 中,但源站未提供各 SubSeries 的具体信息。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。作者为 Benjamin,F,Voight。发布时间为 Jun 22 202。主题标签显示涉及 SNP array 的 SNP 分型,平台为 GPL23391,物种为 9606(人类)。源站未提供样本采集地点、组织处理流程、分型或表达检测的具体实验方案等信息。

【适用场景】

该数据集适用于儿童特应性疾病遗传因素相关的研究场景,例如围绕扁桃体组织表达数量性状位点开展遗传调控分析、SNP 分型数据的核对与整合,以及免疫系统疾病与过敏方向的探索性研究。由于其为 SuperSeries,也可用于了解相关 SubSeries 的组织方式。源站未提供具体的分析结论或验证结果,因此不应用于推断该数据集已证实的遗传位点。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE336131_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。源站未提供额外的读取脚本、预处理步骤或分析流程说明。

【质量与限制】

源站未提供质量控制指标、缺失值情况、批次信息或数据完整性说明。数据集仅含 1 个文件,且作为 SuperSeries 其详细内容依赖所列 SubSeries,源站未提供这些子系列的具体信息。使用时应注意上述信息缺口,避免对数据覆盖范围作出超出源站描述的判断。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款。作者信息为 Benjamin,F,Voight,发布时间为 Jun 22 202。使用或再分发前应向来源站 ncbi.nlm.nih.gov 核实引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336131

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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