人类初始与记忆B细胞亚群的转录组-蛋白质组分析揭示同种型与亚类特异性表型

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298777

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数据说明

B细胞产生的抗体有助于识别和清除病原体，是疫苗接种策略的基石。人类产生九种不同的抗体同种型，其效应功能因抗原类型和暴露途径而异。同种型转换后的B细胞亚群之间存在表型差异是预期之中的，但尚未得到详细研究。为了从分子层面定义同种型决定的B细胞身份，我们对人类初始B细胞和记忆B细胞（MBCs）中同种型确定的群体进行了蛋白质组学和转录组学分析：CD27-IgM+IgD+、CD27+CD38lo/-IgM+IgD+、CD27+CD38lo/-IgM+IgD-，以及IgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3和IgG4 MBCs（CD27+CD38lo/-Ig+）。蛋白质组与转录组联合分析揭示，mRNA和蛋白质表达谱根据分化状态将不同的同种型确定B细胞亚群区分开来。许多基因的mRNA与蛋白质表达水平相关性良好。IgG4+ MBCs与初始B细胞的差异最为显著。除了细胞因子和Fc受体表达谱的差异外，我们还发现IgG4转换后的B细胞中IgE编码mRNA的高表达。

SDR16C5被鉴定为在IgG4转换的B细胞中独特上调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。