ImmgenT 开源项目数据集

GSE297097 是 NCBI GEO 上的 ImmgenT 开源项目 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,主题标签为高通量测序表达谱分析,涉及平台 GPL24247 与物种 10090,本站归类为免疫系统疾病/过敏

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE297097: The ImmgenT Open-Source project

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

ImmgenT 开源项目数据集

GSE297097 是 NCBI GEO 上发布的一项名为“The ImmgenT Open-Source project”的 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,主题标签为高通量测序表达谱分析,涉及平台 GPL24247 与物种 10090,本站将其归类为免疫系统疾病/过敏方向。该数据集以表达谱分析为核心,面向免疫相关研究场景提供开源数据资源,作者为 Liang,Yang,发布时间为 May 13 202。数据集当前提供 1 个文件,样例文件为 GSE297097_series_matrix.txt.gz,用户可据此获取系列矩阵形式的数据内容。

【数据集背景】

该数据集源自 NCBI GEO,标题为“The ImmgenT Open-Source project”,定位为开源项目性质的 SuperSeries。按照 GEO 的组织方式,SuperSeries 用于汇总其下所列的若干 SubSeries,从而将同一项目下的多个子系列组织为一个整体入口。本站将其归入免疫系统疾病/过敏分类,主题标签指向高通量测序表达谱分析,涉及平台 GPL24247 与物种 10090。作者信息为 Liang,Yang,发布时间为 May 13 202。

【数据内容】

数据集当前包含 1 个文件,样例文件名为 GSE297097_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件,以 GZIP 压缩包形式提供。主题标签表明其数据类型为 Expression profiling by high throughput sequencing,即基于高通量测序的表达谱分析;涉及的平台编号为 GPL24247,物种编号为 10090。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未进一步展开各 SubSeries 的具体内容。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。源站描述为“This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.”,说明该 SuperSeries 的组成单元为其下所列的 SubSeries。作者为 Liang,Yang。其余关于样本采集地点、时间、实验条件与处理流程的信息,源站未提供。

【适用场景】

依据本站分类与主题标签,该数据集适用于免疫系统疾病与过敏相关方向的表达谱研究场景,可用于高通量测序表达数据的查阅与二次分析。由于其为 SuperSeries,适合作为项目级入口,用于定位其下属 SubSeries 所对应的具体子研究。具体到某一疾病模型、某一细胞类型或某一实验条件的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE297097_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以降低因字段解析或编码不一致导致的错误风险。对于 SuperSeries 结构,可结合其下属 SubSeries 分别组织分析流程。其余分析参数与流程细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 GEO 上的 SuperSeries,其内容由若干 SubSeries 组成,源站描述未给出各 SubSeries 的具体清单与质量评估信息。当前可获取的文件数量为 1,样例文件为系列矩阵文件。关于数据完整性、批次效应、样本量、测序深度等质量指标,源站未提供。使用时应注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,避免重复或遗漏。

【引用与许可】

作者为 Liang,Yang,发布时间为 May 13 202。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297097

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本超级系列由下列子系列组成。补充文件截至2025年7月8日有效。v1 - 2025年5月14日 v2 - 2025年7月8日

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