BP 2015年1月 DNase超敏性 CD14阳性CD16阴性经典单核细胞样本

该数据集来自 BLUEPRINT 2015年1月发布,包含5个 CD14阳性、CD16阴性经典单核细胞样本的 DNase-Hypersensitivity 数据,对应5次运行、5个实验和5次比对

omicsdi
浏览 15
基因组分类Genomics
BP_January_2015_DNase-Hypersensitivity_CD14-positive,_CD16-negative_classical_monocyte - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

BP 2015年1月 DNase超敏性 CD14阳性CD16阴性经典单核细胞样本

BP_January_2015_DNase-Hypersensitivity_CD14-positive,_CD16-negative_classical_monocyte - samples 是一个聚焦于免疫系统疾病与过敏方向的基因组学数据集,来源于 omicsdi.org。该数据集收录了 5 个 CD14 阳性、CD16 阴性经典单核细胞样本的 DNase-Hypersensitivity 数据,对应 5 次运行、5 个实验和 5 次比对,属于 BLUEPRINT 项目 2015 年 1 月发布的内容。整体而言,它为研究经典单核细胞在染色质开放状态层面的特征提供了可用的数据资源,主题标签为 Genomics,适合对免疫相关细胞调控机制感兴趣的科研人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集属于 BLUEPRINT 项目 2015 年 1 月发布的一部分。BLUEPRINT 是一个面向人类血液细胞的研究项目,其发布内容通常涉及多种血细胞类型的表观遗传与基因组特征。本数据集聚焦于 CD14 阳性、CD16 阴性经典单核细胞,这类细胞是单核细胞中的一个重要亚群。数据集被归类在免疫系统疾病与过敏方向,说明其潜在应用场景与免疫相关疾病研究存在关联。源站描述中提供了分析文档的获取地址,指向 EBI 的 BLUEPRINT 发布目录,供使用者查阅 DNase-seq 分析相关的说明材料。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 DNase-Hypersensitivity 数据,覆盖 5 个 CD14 阳性、CD16 阴性经典单核细胞样本。根据源站描述,这 5 个样本对应 5 次运行、5 个实验和 5 次比对,说明数据在运行、实验和比对三个层面各包含 5 条记录。DNase-Hypersensitivity 数据通常用于反映染色质开放区域,即调控元件可能活跃的位置。该数据集的主题标签为 Genomics,表明其属于基因组学范畴。除上述信息外,关于数据的具体文件格式、分辨率、覆盖度等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,属于 BLUEPRINT 项目 2015 年 1 月发布的内容。源站描述中给出了分析文档的链接,指向 http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/blueprint/releases/20140811/homo_sapiens/README_dnaseseq_analysis_20140811,供使用者了解 DNase-seq 分析的相关说明。关于样本的具体采集方式、供体信息、伦理审批等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于基因组学与免疫学交叉领域的研究场景。由于聚焦于 CD14 阳性、CD16 阴性经典单核细胞的 DNase-Hypersensitivity 特征,它可用于探索这类细胞的染色质开放状态,进而辅助理解免疫相关调控机制。数据集被归类在免疫系统疾病与过敏方向,因此也可能为过敏或免疫系统疾病相关研究提供参考。此外,作为 BLUEPRINT 项目发布内容的一部分,它可用于与其他血液细胞类型的表观遗传数据进行对比分析。关于具体的分析流程或推荐工具,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 omicsdi.org 获取该数据集,并参考源站描述中提供的分析文档链接了解 DNase-seq 分析的相关说明。该数据集包含 5 次运行、5 个实验和 5 次比对,使用者可根据自身研究需求选择相应的数据层级进行分析。关于数据下载的具体步骤、所需软件或处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含 5 个样本,对应 5 次运行、5 个实验和 5 次比对,样本数量相对有限。关于数据质量评估指标、是否存在批次效应、数据覆盖度或重复性等信息,源站未提供。使用者在使用时应注意样本规模对统计效力的潜在影响。关于数据的其他限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集,应参考 omicsdi.org 及 BLUEPRINT 项目发布页面的相关说明。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001130

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DNase-Hypersensitivity data for 5 CD14-positive, CD16-negative classical monocyte sample(s). 5 run(s), 5 experiment(s), 5 alignment(s). Part of BLUEPRINT release January 2015. Analysis documentation available at http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/blueprint/releases/20140811/homo_sapiens/README_dnaseseq_analysis_20140811

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案