原发性骨髓纤维化患者JAK2外显子14跳跃:受JAK2-V617F等位基因负荷调节的次要剪接变异
该数据集来自plos.figshare.com,配套2015年发表于PLOS ONE的研究,聚焦原发性骨髓纤维化(PMF)患者中JAK2基因外显子14跳跃形成的剪接异构体JAK2Δ14

基本信息
资源简介
原发性骨髓纤维化患者JAK2外显子14跳跃:受JAK2-V617F等位基因负荷调节的次要剪接变异
JAK2 Exon 14 Skipping in Patients with Primary Myelofibrosis: A Minor Splice Variant Modulated by the JAK2-V617F Allele Burden
该数据集来自plos.figshare.com,配套2015年发表于PLOS ONE的研究,聚焦原发性骨髓纤维化(PMF)患者中JAK2基因外显子14跳跃形成的剪接异构体JAK2Δ14。数据包含9个文件(5张图、3份表及论文相关材料),涉及44例PMF患者与9名健康供者外周血粒细胞中JAK2Δ14与全长JAK2转录本的RT-qPCR比值测定。该数据可用于探究JAK2Δ14在骨髓增殖性疾病中的表达特征及其与JAK2-V617F等位基因负荷的关系(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《JAK2 Exon 14 Skipping in Patients with Primary Myelofibrosis: A Minor Splice Variant Modulated by the JAK2-V617F Allele Burden》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0116636。源站首次发布:2015-01-24。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 原发性骨髓纤维化(PMF)是一种造血干细胞 compartment 的获得性克隆性疾病,以骨髓纤维化、贫血、脾肿大和髓外造血为特征。约60%的PMF患者在其造血谱系中携带JAK2基因的体细胞突变(JAK2-V617F)。最近,在骨髓增殖性疾病患者中描述了一种缺乏外显子14的JAK2剪接异构体(JAK2Δ14)。材料与方法 通过使用特异性RT-qPCR方法,我们测量了从44例PMF患者和9名健康供者外周血中分离的粒细胞中剪接异构体与JAK2全长转录本(JAK2+14)之间的比值。结果 我们发现JAK2Δ14在患者中仅轻微升高,并且与已发表数据不同,该剪接异构体在健康对照中也可检测到。我们还发现
【数据结构与技术规格】
文件数 9 个,合计 1.48 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0116636。
【主题与分类】
源站学科分类:Uncategorised。主题标签:JAK 2 exon 14、JAK 2 gene、Jak 2、bone marrow fibrosis、exon 14、pmf、JAK 2Δ14 isoform、Minor Splice Variant Modulated。本站分类:血液与淋巴系统疾病/骨髓纤维化。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Uncategorised。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_JAK2_Exon_14_Skipping_in_Patients_with_Primary_Myelofibrosis_A_Minor_Splice_Variant_Modulated_by_the_JAK2_V617F_Allele_Burden/1294390
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Catarsi, Paolo; Rosti, Vittorio; Morreale, Giacomo; Poletto, Valentina; Villani, Laura; Bertorelli, Roberto; et al. (2016). JAK2 Exon 14 Skipping in Patients with Primary Myelofibrosis: A Minor Splice Variant Modulated by the JAK2-V617F Allele Burden. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:<i>JAK2</i> Exon 14 Skipping in Patients with Primary Myelofibrosis: A Minor Splice Variant Modulated by the JAK2-V617F Allele Burden
- DOI:10.1371/journal.pone.0116636
- 发布日期:2015-01-24
- 文件数:9 个
- 文件总体积:1.48 MB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_JAK2_Exon_14_Skipping_in_Patients_with_Primary_Myelofibrosis_A_Minor_Splice_Variant_Modulated_by_the_JAK2_V617F_Allele_Burden/1294390
命令行下载
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文件清单
S1_Fig.jpeg(279.97 KB)S2_Fig.jpeg(130.63 KB)S3_Fig.jpeg(186.21 KB)S4_Fig.jpeg(417.78 KB)S5_Fig.jpeg(209.37 KB)S1_Table.pdf(63.35 KB)S2_Table.pdf(69.24 KB)S3_Table.pdf(47.72 KB)S4_Table.pdf(73.53 KB)
文件总体积 1.48 MB(源站 API 实测)。
数据说明
背景
原发性骨髓纤维化(PMF)是一种获得性造血干细胞克隆性疾病,以骨髓纤维化、贫血、脾肿大及髓外造血为特征。约60%的PMF患者其造血谱系中携带JAK2基因的体细胞突变(JAK2-V617F)。近年来,在骨髓增殖性疾病患者中报道了一种缺失外显子14的JAK2剪接异构体(JAK2Δ14)。材料与方法
采用特异性RT-qPCR方法,我们检测了44例PMF患者及9例健康供者外周血分离粒细胞中剪接异构体与JAK2全长转录本(JAK2+14)的比值。结果
我们发现JAK2Δ14在患者中仅轻度升高,且与已发表数据不同,该剪接异构体在健康对照中亦可检测到。我们还发现,在携带JAK2-V617F突变的患者中,突变等位基因的百分比与观察到的JAK2Δ14升高相关。该突变的纯合状态亦与较高水平的JAK2+14相关。
生物信息学分析表明,G>T颠换可能通过改变剪接调控序列而干扰外显子14的正确剪接。结论:JAK2全长转录本水平升高以及JAK2外显子14跳跃的小幅但显著增加,与PMF粒细胞中JAK2-V617F等位基因负荷相关。我们的数据未能证实此前关于JAK2Δ14异构体产生与PMF发病机制相关的说法。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0116636(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_JAK2_Exon_14_Skipping_in_Patients_with_Primary_Myelofibrosis_A_Minor_Splice_Variant_Modulated_by_the_JAK2_V617F_Allele_Burden/1294390)。
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