IDR idr0096-tratwal-marrowquant 骨髓定量成像数据集(experimentA)
主题标签:多发性骨髓瘤、血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:血液与淋巴系统疾病/多发性骨髓瘤

基本信息
资源简介
IDR idr0096-tratwal-marrowquant 骨髓定量成像数据集(experimentA)
IDR idr0096-tratwal-marrowquant (experimentA) 是一个聚焦于多发性骨髓瘤与血液及淋巴系统疾病方向的骨髓成像数据集,收录于 Image Data Resource(IDR)平台,该平台由 OME 与 EMBL-EBI 提供支持,属于经过策展的细胞与组织成像研究资源。该数据集以 experimentA 为实验标识,共包含 8 幅图像,主题涵盖多发性骨髓瘤、血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像与组织成像等方向。在本站分类体系中,它被归入“血液与淋巴系统疾病 / 多发性骨髓瘤”类别,适合关注骨髓微环境、血液肿瘤病理形态以及相关细胞与组织成像分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
多发性骨髓瘤是一种起源于浆细胞的血液系统恶性肿瘤,其发生、发展及治疗反应与骨髓微环境密切相关。对该疾病的深入研究,往往依赖于对骨髓组织与细胞形态的精细观察。IDR idr0096-tratwal-marrowquant 正是在这一研究背景下产生的成像数据集,其名称中的“marrowquant”提示其与骨髓定量分析相关,而“experimentA”则标识了该研究中的一个具体实验。该数据集被纳入 IDR 这一经过策展的细胞与组织成像研究资源,说明其数据组织遵循 OME 相关规范,便于在统一框架下进行检索、浏览与再利用。
【数据内容】
该数据集共包含 8 幅图像,主题标签覆盖多发性骨髓瘤、血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像与组织成像。从这些标签可以理解,数据内容以骨髓相关样本的成像为主,既涉及组织层面的形态信息,也涉及细胞层面的观察结果。图像数据以 OME 相关格式组织,属于 IDR 策展研究的一部分。除上述信息外,关于图像的具体分辨率、通道设置、染色方法、样本数量及定量指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 idr.openmicroscopy.org,属于 Image Data Resource(IDR)平台,由 OME 与 EMBL-EBI 提供支持。IDR 是一个经过策展的细胞与组织成像研究资源,致力于汇集并公开可复用的生物成像数据。该数据集在 IDR 中的标识为 idr0096-tratwal-marrowquant,实验标识为 experimentA。关于具体的成像仪器、采集参数、样本制备流程及实验条件等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与分类,该数据集可适用于多发性骨髓瘤及血液与淋巴系统疾病相关的骨髓成像研究,也可用于细胞成像与组织成像方法的展示与比较。由于数据以策展形式发布于 IDR,它还可用于成像数据的浏览、检索与再利用实践,以及作为 OME 规范下数据组织方式的参考示例。关于该数据集是否适用于特定的定量分析、算法训练或临床诊断场景,源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集可通过 IDR 平台访问,来源站为 idr.openmicroscopy.org,研究标识为 idr0096-tratwal-marrowquant,实验为 experimentA。使用者可借助 IDR 提供的浏览与检索功能查看这 8 幅图像。关于具体的下载方式、数据格式转换、分析工具推荐或许可操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 IDR 进行策展,属于经过整理的细胞与组织成像研究资源,这在一定程度上支持其数据的规范性与可发现性。然而,该数据集仅包含 8 幅图像,规模相对有限。关于图像质量、分辨率、标注完整性、批次效应及潜在偏差等具体质量指标,源站未提供。使用者应结合自身研究目的评估其适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 IDR 平台,标识为 idr0096-tratwal-marrowquant,实验为 experimentA。关于具体的引用格式、作者信息、许可条款及使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅来源站的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2102
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDR study idr0096-tratwal-marrowquant. Experiment: experimentA. Images: 8. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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