经典霍奇金淋巴瘤单细胞转录组数据集
GSE179212是经典霍奇金淋巴瘤的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集。数据集涵盖多例经典霍奇金淋巴瘤患者的淋巴结样本,在单细胞分辨率下勾勒出HRS细胞与浸润T细胞、B细胞及骨髓细胞的精细图谱,用于免疫逃逸分子通路的高分辨率研究。

基本信息
资源简介
经典霍奇金淋巴瘤单细胞转录组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《KRAS inhibitor-resistance in MET-amplified KRASG12C 1 non-small cell lung cancer induced by RAS- and non-RAS-mediated cell signaling mechanism》。源站首次发布:Jun 30 202。
【数据内容】
源站原始描述:Treatment with KRASG12C inhibitors such as sotorasib can produce substantial regression of tumors in some patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). These patients require alternative treatment after acquiring resistance to the inhibitor. The mechanisms underlying this acquired resistance are unclear. The purpose of this study was to identify the mechanisms underlying acquired sotorasib resistance, and to explore potential treatments for rescuing patients with sotorasib-resistant KRASG12C…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL23159、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179212
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 02 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179212
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 4.80 GB。
数据说明
该数据集利用单细胞RNA测序技术,对经典霍奇金淋巴瘤患者病变淋巴结内的各类细胞进行了转录组分析,是高分辨率探索肿瘤微环境的核心数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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