经典霍奇金淋巴瘤基因表达谱数据集

GSE12453是一个专注于经典霍奇金淋巴瘤(cHL)分子层面的转录组数据集。它通过微切割技术获取了患者体内的Hodgkin出Reed-Sternberg (HRS) 细胞,并提供了其基因表达谱数据,可用于发病机制、免疫调节及肿瘤标志物筛选研究。

University of KielUniversity of Kiel
Gene Expression Omnibus
2019-06-03 更新
浏览 11
表格分类

基本信息

模态
表格
大小
0.05 GB
数据量
25
任务类型
分类
许可
CC0 1.0
创建/更新时间
2019-06-03

资源简介

该数据集收集了通过显微切割获取的经典霍奇金淋巴瘤患者原代Hodgkin和Reed-Sternberg (HRS)细胞的转录组数据,用以研究该疾病的特异性分子机制。

原始链接

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12453

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    • OpenDataLab: pip install openxlabopenxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.05 GB

数据说明

该数据集收集了通过显微切割获取的经典霍奇金淋巴瘤患者原代Hodgkin和Reed-Sternberg (HRS)细胞的转录组数据,用以研究该疾病的特异性分子机制。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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