PXD000729：TAF10与GATA1转录因子相互作用并调控小鼠红细胞生成
该数据集来自ebi.ac.uk，围绕小鼠与人类红系细胞中TFIID和SAGA（含TAF10复合物）的化学计量开展定量分析，并在不同分化与发育阶段的红系细胞中进行TAF10免疫沉淀结合定量质谱，鉴定出TFIID和SAGA与多个转录因子尤其是GATA-1的相互作用；同时在MEL细胞中通过GATA-1免疫
基本信息
资源简介
PXD000729：TAF10与GATA1转录因子相互作用并调控小鼠红细胞生成
PXD000729 数据集围绕小鼠与人类红系细胞中 TFIID 和 SAGA（含 TAF10 的复合物）的化学计量开展定量分析，并在不同分化与发育阶段的红系细胞中进行 TAF10 免疫沉淀结合定量质谱，鉴定出 TFIID 和 SAGA 与多个转录因子尤其是 GATA-1 的相互作用；同时在 MEL 细胞中通过 GATA-1 免疫沉淀及质谱分析，反向验证了其与 TFIID 和 SAGA 亚基的相互作用。该数据集来源于 ebi.ac.uk，归类于血液与淋巴系统疾病 / 其他，主题涉及 Gata-1、Taf10 以及急性白血病、多囊肾等相关疾病本体标签，为研究红系分化调控与相关疾病机制提供了蛋白质相互作用层面的数据基础。
【数据集背景】
转录因子 TFIID 与 SAGA 是参与基因转录调控的重要复合物，其中 TAF10 是二者的共有亚基。在红系细胞中，这些复合物与谱系决定因子 GATA-1 之间的相互作用，对红系发育与分化的转录程序具有关键意义。该数据集正是针对这一生物学问题，通过定量蛋白质组学手段系统刻画 TFIID 与 SAGA 在红系细胞中的化学计量及其与转录因子的相互作用网络，为理解红系造血调控及相关血液系统疾病的分子机制提供数据支撑。
【数据内容】
数据集的核心内容包含两类免疫沉淀-定量质谱实验：其一是在小鼠与人类红系细胞中，对不同分化与发育阶段的细胞开展 TAF10 免疫沉淀，随后进行定量质谱分析，从而量化 TFIID 与 SAGA 的化学计量，并鉴定其与多个转录因子（尤其是 GATA-1）的相互作用；其二是在 MEL 细胞中开展 GATA-1 免疫沉淀并结合质谱分析，反向鉴定 GATA-1 与 TFIID、SAGA 各亚基之间的相互作用。主题标签涵盖 Gata-1、Taf10，并关联急性白血病（DOID:12603）与多囊肾（DOID:5928）等疾病本体条目。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。实验体系涉及小鼠与人类红系细胞，以及小鼠红白血病（MEL）细胞；技术路线为免疫沉淀（IP）结合定量质谱（MS），覆盖红系细胞的不同分化与发育阶段。源站未提供样本数量、质谱平台型号、仪器参数及具体实验批次等更细粒度的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于红系造血与转录调控相关研究，例如：分析 TFIID 与 SAGA 复合物在红系分化过程中的化学计量变化；研究 TAF10 与 GATA-1 等转录因子之间的相互作用网络；以 MEL 细胞为模型验证 GATA-1 与 TFIID/SAGA 亚基的反向互作；以及结合急性白血病、多囊肾等疾病本体标签，探索相关疾病背景下转录调控复合物的潜在关联。也可作为蛋白质相互作用与定量蛋白质组学方法学的参考数据。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据文件格式、检索参数、定量分析流程及复现步骤等。使用者需依据源站提供的原始与 processed 数据自行设计分析方案。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，如重复数、置信度阈值、缺失值比例及定量准确性指标等。需注意该数据集基于免疫沉淀与质谱技术，其结果受抗体特异性、样本制备与质谱检测灵敏度等因素影响；相关结论的适用范围应结合源站描述与原始文献加以判断。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用时应遵循源站（ebi.ac.uk）的相关数据使用政策，并引用对应原始文献。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000729
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TFIID和SAGA（含TAF10的复合物）的化学计量已在小鼠和人类红系细胞中进行了定量分析。在不同分化和发育阶段的红系细胞中进行了TAF10免疫沉淀（IP），随后进行了定量质谱（MS）分析。已鉴定出TFIID和SAGA与多种转录因子，特别是与GATA-1的相互作用。在MEL细胞中进行GATA-1免疫沉淀（IP）后，经MS分析也鉴定出了与TFIID和SAGA亚基的反向相互作用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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