RPS19缺失HeLa细胞中含RRP12复合物的蛋白质组学分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD077805

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含对从人HeLa细胞中分离的含RRP12复合物进行的基于质谱的蛋白质组学分析。该研究旨在分析核糖体生物发生因子RRP12在RPS19缺陷背景下的相互作用组，RPS19缺陷是一种与Diamond-Blackfan贫血相关的缺陷。使用Singh等人（2021；PMID: 34516797）描述的前核糖体提取和GFP-Trap免疫沉淀方案，从对照和RPS19敲低的HeLa细胞（内源性表达GFP-RRP12）中纯化复合物。对RRP12相关蛋白含量的比较定量分析（以每个样品中RRP12的量进行归一化）揭示，在RPS19耗竭后，含有SSU-processome核糖体生物发生因子（RBFs）的大型前核糖体复合物发生积累。这些发现的描述以及相关的原始数据分析表，收录于Gaspar等人（2026）题为“Convergent nuclear proteostasis alterations across ribosomal protein deficiencies”的文章中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。