基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB120955：SMIM1 驱动替代性血红蛋白摄取通路

PRJEB120955 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的生物学项目数据集，其英文名称为“SMIM1 drives an alternative hemoglobin uptake pathway”，中文可译为“SMIM1 驱动替代性血红蛋白摄取通路”。该数据集在 BioProject 中的编号为 PRJEB120955，源站标题为“SMIM1 drives an alternative hemoglobin uptake path... (ID 1539207) - BioProject - NCBI”。从主题上看，该数据集聚焦于 SMIM1 在血红蛋白摄取过程中所扮演的角色，特别是其驱动替代性摄取通路的机制。本站将其归类于“血液及造血器官疾病 / 其他”类别，主题标签为“Other”。整体而言，该数据集为研究者提供了一个与 SMIM1 及血红蛋白摄取通路相关的生物学项目入口，便于集中获取该项目所产生的多种类型数据。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种资源集合，用于汇集与某一特定研究计划相关的生物学数据。根据源站描述，一个 BioProject 记录通常源自单一组织或联盟，旨在为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的多种数据类型。PRJEB120955 正是这样一个 BioProject 记录，其核心主题为 SMIM1 驱动替代性血红蛋白摄取通路。该主题涉及血液及造血器官疾病领域，可能有助于理解血红蛋白摄取的相关生物学过程。本站将其分类为“血液及造血器官疾病 / 其他”，并赋予“Other”作为主题标签，表明其在现有分类体系中可能属于较为专门或交叉的研究方向。

【数据内容】

该数据集的具体数据内容未在源站描述中详细列出。根据 BioProject 的一般定义，一个 BioProject 记录会链接到该项目生成的多种数据类型，但 PRJEB120955 具体包含哪些数据文件、数据量大小、样本数量、实验类型等信息，源站未提供。因此，无法确定该数据集内部是否包含基因组、转录组、蛋白质组或其他类型的数据。用户若需了解详细的数据内容，应访问 NCBI BioProject 页面查看该项目的具体链接和关联数据。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的官方网站。其源站标题显示为“SMIM1 drives an alternative hemoglobin uptake path... (ID 1539207) - BioProject - NCBI”，表明该记录是 NCBI BioProject 数据库中的一个条目。关于该项目的具体采集方法、样本来源、实验设计、时间范围、地理区域等信息，源站未提供。因此，无法进一步说明其数据采集的具体过程或来源细节。

【适用场景】

基于该数据集的主题“SMIM1 驱动替代性血红蛋白摄取通路”以及本站分类“血液及造血器官疾病 / 其他”，该数据集可能适用于与血液学、造血器官疾病、血红蛋白代谢、SMIM1 基因功能等相关的研究场景。例如，研究人员可能利用该数据集探索 SMIM1 在血红蛋白摄取中的替代通路机制，或将其作为血液疾病相关研究的参考数据。然而，由于源站未提供具体的数据类型和内容，无法确定其是否适用于特定的分析流程，如基因表达分析、变异检测或通路富集分析。因此，适用场景仅能基于主题进行一般性推断，具体应用需结合项目实际数据。

【使用方法】

关于该数据集的使用方法，源站未提供具体说明。通常，BioProject 记录本身并不直接提供数据分析工具或操作指南，而是作为数据链接的入口。用户可能需要通过 NCBI 的相关平台或工具来访问和下载该项目关联的数据。由于缺乏具体信息，无法说明如何下载、处理或分析该数据集。建议用户直接访问 NCBI BioProject 页面，查看 PRJEB120955 的详细记录，以获取可用的数据链接和使用指引。

【质量与限制】

该数据集的质量信息、数据完整性、准确性、覆盖范围等，源站未提供。同时，其限制条件，如数据使用权限、样本量限制、技术偏差等，也未在源站描述中说明。用户在使用该数据集时，应注意其可能存在的局限性，并参考 NCBI BioProject 的通用数据标准。由于缺乏具体细节，无法评估该数据集的质量水平或明确其使用限制。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用条款等信息，源站未提供。用户若需引用或使用该数据集，应查阅 NCBI BioProject 页面上的相关说明，或联系数据提交者以获取授权信息。在缺乏明确许可信息的情况下，建议遵循 NCBI 的一般使用政策。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB120955

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB120955

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

铁对众多生物过程至关重要，其在人体细胞中的充足含量对于预防贫血或毒性过载极为关键。尽管转铁蛋白受体介导的铁摄取是经典途径，人体细胞还拥有一种尚未被研究的替代路径。为了揭示这一缺失的机制，我们开发了一种功能获得性方法，将基因与细胞数量性状关联起来，并发现了SMIM1——一种负责罕见Vel血型抗原的跨膜蛋白，其功能未知，作为铁稳态的关键调节因子。我们发现，SMIM1的表达完全抑制了由转铁蛋白受体缺失引起的铁缺乏。从机制上讲，SMIM1通过其HKCK基序与血红蛋白(Hb)结合，经由网格蛋白依赖的内吞作用介导Hb的铁摄取，随后转运至溶酶体并释放铁。在人类中，SMIM1的遗传变异影响Hb水平和红细胞性状。SMIM1缺陷小鼠在红细胞生成应激下，其红系前体细胞表现出铁缺乏，强调了这一过程的生理相关性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别