PCAM
淋巴结切片组织病理学图像数据集,包含32万张96×96像素彩色图像。
基本信息
资源简介
该数据集包含327,680张从淋巴结切片组织病理学扫描中提取的彩色图像,尺寸为96×96像素,用于病理图像分析。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
免登录有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放千方医数集,医疗数据集部分,是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎,并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求,可以和客服联系,或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取(ModelScope)
方式一:MsDataset(Python)
# 前置依赖: pip install modelscope
from modelscope.msdatasets import MsDataset
ds = MsDataset.load("ai4s/PCAM", subset_name="default", split="train")
print(ds)
方式二:CLI(命令行)
pip install modelscope
modelscope download dataset ai4s/PCAM
数据集卡片摘录(源站)
数据集说明
PCam(PatchCamelyon)是一个专为深度学习在医学图像分类领域服务的图像数据集。它旨在作为一个新的基准,用于在合理计算资源下(例如单个GPU)训练模型,以完成一项重要的临床任务——从病理图像中检测转移性癌组织。
- 基础数据来源与数据分布
PCam 的基础数据来源于 Camelyon16 挑战赛中的乳腺癌淋巴结转移检测数据。研究人员从这些高分辨率的全扫描数字病理切片中,裁剪并处理了总计 327,680张 96x96像素的彩色小图像。这些图像被分为三个部分,并确保了正样本(含有转移性组织)和负样本(不含转移性组织)的比例在每个集合中都保持平衡:
训练集:包含 262,144 张图像。
验证集:包含 32,768 张图像。
测试集:包含 32,768 张图像。
- 数据集样例
数据集的每个样例都是一个 96x96 像素的彩色 PNG 图像文件。图像是淋巴结病理切片中的小块区域,肉眼上可能包含或不包含微小的癌细胞团。每个图像都配有一个简单的二元标签:0 代表不含转移性组织,1 代表含有转移性组织。
3. 数据集文件内容与结构说明
PCam 数据集的文件结构 HDF5 格式提供,文件结构包含:
camelyonpatch_level_2_split_train.h5 的训练集文件
camelyonpatch_level_2_split_test.h5 的测试集文件
camelyonpatch_level_2_split_valid.h5 的验证集文件
这些 .h5 文件内部通常包含两个核心数据集:
x:一个包含所有图像数据的 NumPy 数组(例如,形状为 (N, 96, 96, 3),其中 N 为样本数)。
y:一个包含对应标签的 NumPy 数组(例如,形状为 (N, 1)),其中 1 表示转移性组织,0 表示非转移性组织。
下载方法
:modelscope-code[]{type=“sdk”}
:modelscope-code[]
许可
MIT License
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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