MaHPIC Experiment 25 (E25) 临床结果数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.25739/70ze-8c03

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

实验25：恒河猴(Macaca mulatta)在异源攻击中感染食蟹猴疟原虫锡兰株(Plasmodium cynomolgi strain ceylonensis)，以产生并整合急性原发感染和复发的临床、血液学、寄生虫学及组学指标。该临床结果数据集包含疾病感染指标，包括以下项目的计数和计算：全血细胞计数(CBCs)、网织红细胞、疟原虫血症，以及下游的免疫学、功能基因组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学测量。结果还包括兽医提供的关于动物获取各方面数据和元数据，包括但不限于：治疗、血液学、生化分析、寄生虫学、细菌学和手术统计等。结果还包括数据收集和分析方法的文档，以及区分“理想化”与“实际”疾病进展的支持性临床材料。这是系列实验中的第三个，该系列包括对疟疾未暴露个体的感染(实验23，食蟹猴疟原虫B株)和对同一队列个体的同源攻击(实验24，食蟹猴疟原虫B株)。受试者已清除了先前的食蟹猴疟原虫(P.

通过抗疟药物蒿甲醚、氯喹和伯氨喹处理食蟹猴B株。有关该数据集的完整描述以及如何访问本实验其他数据集的说明，请参见文件“E25M99MEMmCyDaWB_README-PlasmoDB-09262018-V1_MULTIPL.txt”。有关所有公开MaHPIC数据集的描述和位置，请参见https://plasmodb.org/plasmo/mahpic.jsp。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。