IDR idr0096-tratwal-marrowquant 骨髓定量成像数据集
主题标签:血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像、组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:血液与淋巴系统疾病/其他

基本信息
资源简介
IDR idr0096-tratwal-marrowquant 骨髓定量成像数据集
IDR idr0096-tratwal-marrowquant 是一个聚焦骨髓成像的细胞与组织成像研究数据集,收录于 Image Data Resource(IDR),由 OME/EMBL-EBI 进行策展与维护。该数据集在本站被归类为“血液与淋巴系统疾病 / 其他”,其主题标签涵盖血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像、组织成像、IDR、OME 以及 EMBL-EBI。从整体定位来看,它属于经策展的显微成像研究资源,面向对骨髓组织与细胞形态、血液及淋巴系统疾病相关成像数据感兴趣的科研人员。数据集名称中的“marrowquant”提示其与骨髓定量分析相关,但具体定量方法、指标与结论需以源站记录为准。
【数据集背景】
该数据集来源于 IDR(Image Data Resource),这是一个由 OME 与 EMBL-EBI 共同支持的策展型细胞与组织成像研究资源。IDR 的定位是汇集并公开经过策展的成像研究数据,使研究者能够检索、浏览和复用显微成像结果。idr0096-tratwal-marrowquant 作为其中一个研究条目,其主题围绕骨髓成像展开,并与血液与淋巴系统疾病这一大类相关。源站将其描述为“curated cell/tissue imaging study”,即经过策展的细胞/组织成像研究。本站将其归入“血液与淋巴系统疾病 / 其他”分类,说明它在疾病分类体系中属于血液与淋巴系统疾病范畴下的其他类目。关于该研究的具体科学问题、实验假设与立项背景,源站未提供。
【数据内容】
从主题标签可以确认,该数据集包含细胞成像与组织成像内容,成像对象涉及骨髓。数据集名称中的“marrowquant”指向骨髓相关的定量分析,但源站未提供具体的图像数量、视野数、通道配置、分辨率、染色方法、标记物名称或定量指标。该数据集属于血液与淋巴系统疾病主题下的成像研究,因此其内容可能与骨髓组织切片或细胞样本的显微图像有关。除上述标签信息外,源站未提供更细的数据内容说明,例如样本类型、物种来源、实验条件或分组信息。
【采集与来源】
该数据集来自 idr.openmicroscopy.org,即 IDR 的公开访问站点。源站描述指出,它是由 OME/EMBL-EBI 策展的细胞/组织成像研究。IDR 本身是开放显微数据资源,遵循 OME 相关标准与规范。关于具体的采集设备、显微镜型号、物镜参数、成像模式、采集时间、样本制备流程以及原始数据来源实验室,源站未提供。该数据集在 IDR 中的条目编号为 idr0096,研究标识为 idr0096-tratwal-marrowquant,这些标识可用于在 IDR 平台内定位该研究。
【适用场景】
该数据集适用于血液与淋巴系统疾病领域的成像研究,尤其是与骨髓相关的细胞与组织成像分析。潜在用途包括:作为骨髓成像的参考数据用于方法比较、作为细胞与组织成像算法测试的输入、用于教学或培训中的显微图像示例,以及用于探索血液与淋巴系统疾病相关形态学特征。由于该数据集属于经策展的 IDR 研究条目,它也适合用于数据复用与开放科学实践。关于该数据集是否适用于特定疾病亚型、特定物种或特定实验设计,源站未提供,因此不应作超出标签范围的推断。
【使用方法】
该数据集可通过 IDR 公开站点访问,具体入口为 idr.openmicroscopy.org 上对应的研究条目 idr0096-tratwal-marrowquant。使用者通常可以借助 IDR 提供的图像浏览与检索功能查看该研究的成像数据。关于下载格式、数据体积、是否需要特定客户端、是否提供元数据表格、是否支持程序化访问(如 API)等操作细节,源站未提供。建议使用者直接访问 IDR 条目页面以获取实际可用的访问方式与使用说明。
【质量与限制】
该数据集由 OME/EMBL-EBI 进行策展,属于 IDR 中的 curated 研究条目,这通常意味着数据经过一定程度的整理与标准化。但源站未提供该数据集的具体质量控制指标、图像质量评估结果、数据完整性说明或已知偏差。该数据集的主题标签集中在血液与淋巴系统疾病、骨髓成像、细胞成像与组织成像,因此其适用范围可能限于这些主题;对于其他疾病领域或成像模态的适用性,源站未提供。此外,源站未提供样本量、重复数或统计功效等信息,使用者在进行二次分析时应自行评估数据是否满足其研究需求。
【引用与许可】
该数据集来源于 IDR(Image Data Resource),由 OME/EMBL-EBI 策展。关于该数据集的具体引用格式、作者列表、发表文献、DOI、许可协议类型以及使用条款,源站未提供。使用者在引用或复用该数据集时,应访问 IDR 条目页面查阅其官方引用说明与许可信息。由于源站未提供许可细节,无法确认该数据集是否允许商业使用、是否要求署名或是否允许再分发。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2104
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDR study idr0096-tratwal-marrowquant. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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