Aid 是小鼠造血干/祖细胞髓系/红系分化和 DNA 甲基化的关键调控因子（RNA-Seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE88841

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数据说明

近期研究发现，活化诱导胞苷脱氨酶（AID）与十-十一易位（TET）家族成员调控活跃的DNA去甲基化过程。已有报道显示，在多种髓系恶性肿瘤中TET2存在遗传学改变，且造血组织特异性缺失Tet2的小鼠表现出造血干细胞（HSC）自我更新/分化异常，提示TET2是正常及恶性造血过程的主要调控因子。尽管AID与TET在表观遗传基因调控中存在功能联系，但AID缺失在正常造血及髓系转化中的作用仍有待研究。本研究表明，小鼠中Aid缺失导致髓系细胞扩增和红系祖细胞减少，进而引发病理性贫血，这可能归因于髓系/红系谱系特异性转录因子Cebpa和Gata1的表达失调。与小鼠数据一致，沉默AID使人骨髓（BM）细胞的分化偏向髓单核细胞谱系。然而，与Tet2不同，Aid缺失并不促进HSC自我更新增强，也不与Flt3-ITD协同促进髓系白血病发生。

全基因组转录和差异甲基化分析揭示了Aid作为关键表观遗传调控因子的重要作用。这些结果表明，AID和TET2在髓系和红系谱系分化中具有共同效应，并且它们在调控造血干细胞自我更新及髓系转化中的作用并非冗余。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。